Protein–RNA interactions for Protein: J3QMM8

Gm7971, Predicted gene 16429, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7971J3QMM8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm7971J3QMM8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm7971J3QMM8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm7971J3QMM8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm7971J3QMM8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm7971J3QMM8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm7971J3QMM8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm7971J3QMM8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm7971J3QMM8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm7971J3QMM8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm7971J3QMM8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm7971J3QMM8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm7971J3QMM8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm7971J3QMM8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm7971J3QMM8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm7971J3QMM8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm7971J3QMM8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm7971J3QMM8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm7971J3QMM8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm7971J3QMM8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm7971J3QMM8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm7971J3QMM8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm7971J3QMM8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm7971J3QMM8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm7971J3QMM8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm7971J3QMM8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm7971J3QMM8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm7971J3QMM8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm7971J3QMM8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm7971J3QMM8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm7971J3QMM8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm7971J3QMM8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm7971J3QMM8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm7971J3QMM8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm7971J3QMM8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm7971J3QMM8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm7971J3QMM8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm7971J3QMM8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm7971J3QMM8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm7971J3QMM8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm7971J3QMM8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm7971J3QMM8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm7971J3QMM8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm7971J3QMM8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm7971J3QMM8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm7971J3QMM8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm7971J3QMM8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm7971J3QMM8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm7971J3QMM8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm7971J3QMM8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm7971J3QMM8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm7971J3QMM8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm7971J3QMM8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm7971J3QMM8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm7971J3QMM8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm7971J3QMM8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm7971J3QMM8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm7971J3QMM8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm7971J3QMM8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm7971J3QMM8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm7971J3QMM8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm7971J3QMM8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm7971J3QMM8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm7971J3QMM8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm7971J3QMM8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm7971J3QMM8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm7971J3QMM8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm7971J3QMM8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm7971J3QMM8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm7971J3QMM8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm7971J3QMM8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm7971J3QMM8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm7971J3QMM8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm7971J3QMM8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm7971J3QMM8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm7971J3QMM8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm7971J3QMM8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm7971J3QMM8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm7971J3QMM8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm7971J3QMM8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm7971J3QMM8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm7971J3QMM8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm7971J3QMM8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm7971J3QMM8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm7971J3QMM8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm7971J3QMM8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm7971J3QMM8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm7971J3QMM8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm7971J3QMM8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm7971J3QMM8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm7971J3QMM8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm7971J3QMM8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm7971J3QMM8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm7971J3QMM8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm7971J3QMM8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm7971J3QMM8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm7971J3QMM8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm7971J3QMM8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm7971J3QMM8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm7971J3QMM8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms