Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm21818J3KMS6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm21818J3KMS6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm21818J3KMS6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm21818J3KMS6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm21818J3KMS6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm21818J3KMS6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm21818J3KMS6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm21818J3KMS6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm21818J3KMS6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm21818J3KMS6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm21818J3KMS6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm21818J3KMS6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm21818J3KMS6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm21818J3KMS6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm21818J3KMS6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm21818J3KMS6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm21818J3KMS6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm21818J3KMS6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm21818J3KMS6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm21818J3KMS6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm21818J3KMS6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm21818J3KMS6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm21818J3KMS6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm21818J3KMS6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm21818J3KMS6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm21818J3KMS6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm21818J3KMS6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm21818J3KMS6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm21818J3KMS6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm21818J3KMS6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm21818J3KMS6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm21818J3KMS6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm21818J3KMS6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm21818J3KMS6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm21818J3KMS6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm21818J3KMS6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm21818J3KMS6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm21818J3KMS6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm21818J3KMS6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm21818J3KMS6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm21818J3KMS6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm21818J3KMS6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm21818J3KMS6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm21818J3KMS6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm21818J3KMS6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm21818J3KMS6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm21818J3KMS6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm21818J3KMS6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm21818J3KMS6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm21818J3KMS6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm21818J3KMS6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm21818J3KMS6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm21818J3KMS6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm21818J3KMS6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm21818J3KMS6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm21818J3KMS6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm21818J3KMS6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm21818J3KMS6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm21818J3KMS6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm21818J3KMS6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm21818J3KMS6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm21818J3KMS6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm21818J3KMS6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm21818J3KMS6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm21818J3KMS6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm21818J3KMS6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm21818J3KMS6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm21818J3KMS6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm21818J3KMS6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm21818J3KMS6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm21818J3KMS6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm21818J3KMS6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm21818J3KMS6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm21818J3KMS6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm21818J3KMS6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm21818J3KMS6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm21818J3KMS6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm21818J3KMS6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm21818J3KMS6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm21818J3KMS6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm21818J3KMS6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm21818J3KMS6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm21818J3KMS6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm21818J3KMS6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm21818J3KMS6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm21818J3KMS6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm21818J3KMS6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm21818J3KMS6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm21818J3KMS6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm21818J3KMS6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm21818J3KMS6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm21818J3KMS6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm21818J3KMS6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm21818J3KMS6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm21818J3KMS6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm21818J3KMS6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm21818J3KMS6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm21818J3KMS6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm21818J3KMS6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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