Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Tubgcp6G5E8P0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Tubgcp6G5E8P0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Tubgcp6G5E8P0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Tubgcp6G5E8P0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Tubgcp6G5E8P0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Tubgcp6G5E8P0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Tubgcp6G5E8P0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Tubgcp6G5E8P0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Tubgcp6G5E8P0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Tubgcp6G5E8P0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Tubgcp6G5E8P0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
Tubgcp6G5E8P0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Tubgcp6G5E8P0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Tubgcp6G5E8P0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Tubgcp6G5E8P0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Tubgcp6G5E8P0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
Tubgcp6G5E8P0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Tubgcp6G5E8P0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Tubgcp6G5E8P0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Tubgcp6G5E8P0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Tubgcp6G5E8P0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Tubgcp6G5E8P0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Tubgcp6G5E8P0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Tubgcp6G5E8P0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Tubgcp6G5E8P0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Tubgcp6G5E8P0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Tubgcp6G5E8P0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Tubgcp6G5E8P0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Tubgcp6G5E8P0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Tubgcp6G5E8P0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
Tubgcp6G5E8P0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
Tubgcp6G5E8P0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Tubgcp6G5E8P0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Tubgcp6G5E8P0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Tubgcp6G5E8P0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Tubgcp6G5E8P0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Tubgcp6G5E8P0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Tubgcp6G5E8P0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Tubgcp6G5E8P0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Tubgcp6G5E8P0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Tubgcp6G5E8P0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Tubgcp6G5E8P0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Tubgcp6G5E8P0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Tubgcp6G5E8P0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Tubgcp6G5E8P0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Tubgcp6G5E8P0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Tubgcp6G5E8P0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Tubgcp6G5E8P0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Tubgcp6G5E8P0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Tubgcp6G5E8P0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Tubgcp6G5E8P0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Tubgcp6G5E8P0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Tubgcp6G5E8P0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Tubgcp6G5E8P0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Tubgcp6G5E8P0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Tubgcp6G5E8P0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
Tubgcp6G5E8P0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Tubgcp6G5E8P0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Tubgcp6G5E8P0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Tubgcp6G5E8P0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Tubgcp6G5E8P0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Tubgcp6G5E8P0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Tubgcp6G5E8P0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Tubgcp6G5E8P0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
Tubgcp6G5E8P0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Tubgcp6G5E8P0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Tubgcp6G5E8P0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Tubgcp6G5E8P0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
Tubgcp6G5E8P0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Tubgcp6G5E8P0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
Tubgcp6G5E8P0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Tubgcp6G5E8P0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Tubgcp6G5E8P0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Tubgcp6G5E8P0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
Tubgcp6G5E8P0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Tubgcp6G5E8P0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Tubgcp6G5E8P0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Tubgcp6G5E8P0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Tubgcp6G5E8P0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Tubgcp6G5E8P0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Tubgcp6G5E8P0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Tubgcp6G5E8P0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Tubgcp6G5E8P0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Tubgcp6G5E8P0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Tubgcp6G5E8P0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Tubgcp6G5E8P0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Tubgcp6G5E8P0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Tubgcp6G5E8P0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Tubgcp6G5E8P0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Tubgcp6G5E8P0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Tubgcp6G5E8P0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Tubgcp6G5E8P0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Tubgcp6G5E8P0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Tubgcp6G5E8P0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Tubgcp6G5E8P0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Tubgcp6G5E8P0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Tubgcp6G5E8P0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Tubgcp6G5E8P0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Tubgcp6G5E8P0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms