Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Usp17lcG5E8I7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Usp17lcG5E8I7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Usp17lcG5E8I7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Usp17lcG5E8I7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Usp17lcG5E8I7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Usp17lcG5E8I7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Usp17lcG5E8I7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Usp17lcG5E8I7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Usp17lcG5E8I7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Usp17lcG5E8I7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Usp17lcG5E8I7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Usp17lcG5E8I7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Usp17lcG5E8I7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Usp17lcG5E8I7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Usp17lcG5E8I7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Usp17lcG5E8I7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Usp17lcG5E8I7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Usp17lcG5E8I7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Usp17lcG5E8I7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Usp17lcG5E8I7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Usp17lcG5E8I7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Usp17lcG5E8I7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Usp17lcG5E8I7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Usp17lcG5E8I7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Usp17lcG5E8I7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Usp17lcG5E8I7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Usp17lcG5E8I7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Usp17lcG5E8I7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Usp17lcG5E8I7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Usp17lcG5E8I7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Usp17lcG5E8I7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Usp17lcG5E8I7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Usp17lcG5E8I7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Usp17lcG5E8I7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Usp17lcG5E8I7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Usp17lcG5E8I7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Usp17lcG5E8I7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Usp17lcG5E8I7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Usp17lcG5E8I7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Usp17lcG5E8I7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Usp17lcG5E8I7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Usp17lcG5E8I7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Usp17lcG5E8I7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Usp17lcG5E8I7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Usp17lcG5E8I7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Usp17lcG5E8I7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Usp17lcG5E8I7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Usp17lcG5E8I7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Usp17lcG5E8I7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Usp17lcG5E8I7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Usp17lcG5E8I7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Usp17lcG5E8I7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Usp17lcG5E8I7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Usp17lcG5E8I7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Usp17lcG5E8I7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Usp17lcG5E8I7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Usp17lcG5E8I7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Usp17lcG5E8I7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Usp17lcG5E8I7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Usp17lcG5E8I7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Usp17lcG5E8I7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Usp17lcG5E8I7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Usp17lcG5E8I7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Usp17lcG5E8I7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Usp17lcG5E8I7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Usp17lcG5E8I7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Usp17lcG5E8I7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Usp17lcG5E8I7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Usp17lcG5E8I7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Usp17lcG5E8I7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Usp17lcG5E8I7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Usp17lcG5E8I7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Usp17lcG5E8I7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Usp17lcG5E8I7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Usp17lcG5E8I7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Usp17lcG5E8I7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp17lcG5E8I7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp17lcG5E8I7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp17lcG5E8I7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Usp17lcG5E8I7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Usp17lcG5E8I7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Usp17lcG5E8I7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Usp17lcG5E8I7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Usp17lcG5E8I7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Usp17lcG5E8I7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Usp17lcG5E8I7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Usp17lcG5E8I7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Usp17lcG5E8I7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Usp17lcG5E8I7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Usp17lcG5E8I7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Usp17lcG5E8I7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Usp17lcG5E8I7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Usp17lcG5E8I7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Usp17lcG5E8I7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Usp17lcG5E8I7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Usp17lcG5E8I7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Usp17lcG5E8I7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Usp17lcG5E8I7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Usp17lcG5E8I7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
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