Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r58G3X9U3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r58G3X9U3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r58G3X9U3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn1r58G3X9U3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn1r58G3X9U3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn1r58G3X9U3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn1r58G3X9U3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn1r58G3X9U3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn1r58G3X9U3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn1r58G3X9U3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn1r58G3X9U3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn1r58G3X9U3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn1r58G3X9U3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn1r58G3X9U3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn1r58G3X9U3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn1r58G3X9U3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn1r58G3X9U3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Vmn1r58G3X9U3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn1r58G3X9U3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn1r58G3X9U3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn1r58G3X9U3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn1r58G3X9U3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn1r58G3X9U3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn1r58G3X9U3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn1r58G3X9U3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn1r58G3X9U3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn1r58G3X9U3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn1r58G3X9U3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn1r58G3X9U3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn1r58G3X9U3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn1r58G3X9U3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn1r58G3X9U3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn1r58G3X9U3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn1r58G3X9U3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn1r58G3X9U3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn1r58G3X9U3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn1r58G3X9U3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn1r58G3X9U3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn1r58G3X9U3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vmn1r58G3X9U3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vmn1r58G3X9U3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vmn1r58G3X9U3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vmn1r58G3X9U3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn1r58G3X9U3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn1r58G3X9U3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn1r58G3X9U3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn1r58G3X9U3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn1r58G3X9U3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn1r58G3X9U3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn1r58G3X9U3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn1r58G3X9U3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn1r58G3X9U3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn1r58G3X9U3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn1r58G3X9U3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn1r58G3X9U3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn1r58G3X9U3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r58G3X9U3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r58G3X9U3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r58G3X9U3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r58G3X9U3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r58G3X9U3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r58G3X9U3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn1r58G3X9U3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn1r58G3X9U3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn1r58G3X9U3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn1r58G3X9U3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn1r58G3X9U3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vmn1r58G3X9U3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vmn1r58G3X9U3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vmn1r58G3X9U3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vmn1r58G3X9U3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vmn1r58G3X9U3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn1r58G3X9U3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn1r58G3X9U3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vmn1r58G3X9U3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmn1r58G3X9U3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmn1r58G3X9U3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmn1r58G3X9U3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmn1r58G3X9U3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn1r58G3X9U3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn1r58G3X9U3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r58G3X9U3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r58G3X9U3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r58G3X9U3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r58G3X9U3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r58G3X9U3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r58G3X9U3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vmn1r58G3X9U3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vmn1r58G3X9U3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vmn1r58G3X9U3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vmn1r58G3X9U3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Vmn1r58G3X9U3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vmn1r58G3X9U3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vmn1r58G3X9U3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vmn1r58G3X9U3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vmn1r58G3X9U3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vmn1r58G3X9U3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Vmn1r58G3X9U3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vmn1r58G3X9U3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms