Protein–RNA interactions for Protein: G3UZF1

Gm20509, Predicted gene 20509 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20509G3UZF1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm20509G3UZF1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm20509G3UZF1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm20509G3UZF1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm20509G3UZF1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm20509G3UZF1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm20509G3UZF1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm20509G3UZF1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm20509G3UZF1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm20509G3UZF1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm20509G3UZF1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm20509G3UZF1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm20509G3UZF1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm20509G3UZF1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm20509G3UZF1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm20509G3UZF1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm20509G3UZF1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm20509G3UZF1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm20509G3UZF1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm20509G3UZF1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm20509G3UZF1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm20509G3UZF1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm20509G3UZF1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm20509G3UZF1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm20509G3UZF1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm20509G3UZF1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm20509G3UZF1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm20509G3UZF1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm20509G3UZF1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm20509G3UZF1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm20509G3UZF1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm20509G3UZF1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm20509G3UZF1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm20509G3UZF1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm20509G3UZF1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm20509G3UZF1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm20509G3UZF1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm20509G3UZF1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm20509G3UZF1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm20509G3UZF1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm20509G3UZF1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm20509G3UZF1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm20509G3UZF1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm20509G3UZF1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm20509G3UZF1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm20509G3UZF1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm20509G3UZF1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm20509G3UZF1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm20509G3UZF1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm20509G3UZF1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm20509G3UZF1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm20509G3UZF1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm20509G3UZF1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm20509G3UZF1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm20509G3UZF1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm20509G3UZF1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm20509G3UZF1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm20509G3UZF1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm20509G3UZF1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm20509G3UZF1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm20509G3UZF1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm20509G3UZF1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm20509G3UZF1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm20509G3UZF1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm20509G3UZF1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Gm20509G3UZF1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm20509G3UZF1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm20509G3UZF1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm20509G3UZF1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm20509G3UZF1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm20509G3UZF1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm20509G3UZF1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm20509G3UZF1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm20509G3UZF1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm20509G3UZF1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm20509G3UZF1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm20509G3UZF1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm20509G3UZF1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm20509G3UZF1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm20509G3UZF1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm20509G3UZF1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm20509G3UZF1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm20509G3UZF1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm20509G3UZF1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm20509G3UZF1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm20509G3UZF1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm20509G3UZF1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm20509G3UZF1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm20509G3UZF1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm20509G3UZF1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm20509G3UZF1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm20509G3UZF1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm20509G3UZF1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm20509G3UZF1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm20509G3UZF1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm20509G3UZF1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm20509G3UZF1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm20509G3UZF1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm20509G3UZF1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm20509G3UZF1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms