Protein–RNA interactions for Protein: F8VQB8

Npcd, Neuronal pentraxin chromo domain, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NpcdF8VQB8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NpcdF8VQB8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NpcdF8VQB8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NpcdF8VQB8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NpcdF8VQB8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NpcdF8VQB8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NpcdF8VQB8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NpcdF8VQB8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NpcdF8VQB8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NpcdF8VQB8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NpcdF8VQB8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NpcdF8VQB8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NpcdF8VQB8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
NpcdF8VQB8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NpcdF8VQB8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NpcdF8VQB8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NpcdF8VQB8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NpcdF8VQB8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NpcdF8VQB8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NpcdF8VQB8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NpcdF8VQB8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NpcdF8VQB8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NpcdF8VQB8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
NpcdF8VQB8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NpcdF8VQB8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NpcdF8VQB8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
NpcdF8VQB8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NpcdF8VQB8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NpcdF8VQB8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NpcdF8VQB8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NpcdF8VQB8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NpcdF8VQB8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NpcdF8VQB8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NpcdF8VQB8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NpcdF8VQB8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NpcdF8VQB8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NpcdF8VQB8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NpcdF8VQB8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NpcdF8VQB8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NpcdF8VQB8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NpcdF8VQB8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NpcdF8VQB8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
NpcdF8VQB8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NpcdF8VQB8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NpcdF8VQB8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NpcdF8VQB8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NpcdF8VQB8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NpcdF8VQB8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NpcdF8VQB8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NpcdF8VQB8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NpcdF8VQB8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NpcdF8VQB8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NpcdF8VQB8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NpcdF8VQB8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NpcdF8VQB8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NpcdF8VQB8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NpcdF8VQB8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NpcdF8VQB8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NpcdF8VQB8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NpcdF8VQB8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NpcdF8VQB8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NpcdF8VQB8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NpcdF8VQB8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NpcdF8VQB8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NpcdF8VQB8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NpcdF8VQB8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NpcdF8VQB8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
NpcdF8VQB8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
NpcdF8VQB8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NpcdF8VQB8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
NpcdF8VQB8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
NpcdF8VQB8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NpcdF8VQB8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
NpcdF8VQB8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NpcdF8VQB8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NpcdF8VQB8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NpcdF8VQB8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NpcdF8VQB8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NpcdF8VQB8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NpcdF8VQB8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NpcdF8VQB8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NpcdF8VQB8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NpcdF8VQB8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NpcdF8VQB8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NpcdF8VQB8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NpcdF8VQB8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NpcdF8VQB8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NpcdF8VQB8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NpcdF8VQB8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NpcdF8VQB8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NpcdF8VQB8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NpcdF8VQB8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NpcdF8VQB8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NpcdF8VQB8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NpcdF8VQB8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NpcdF8VQB8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NpcdF8VQB8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NpcdF8VQB8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NpcdF8VQB8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NpcdF8VQB8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms