Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
Ercc6F8VPZ5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
Ercc6F8VPZ5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
Ercc6F8VPZ5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
Ercc6F8VPZ5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC44.03■■■■■ 4.64
Ercc6F8VPZ5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.03■■■■■ 4.64
Ercc6F8VPZ5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC44.02■■■■■ 4.64
Ercc6F8VPZ5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
Ercc6F8VPZ5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
Ercc6F8VPZ5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
Ercc6F8VPZ5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC44.01■■■■■ 4.64
Ercc6F8VPZ5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC44.01■■■■■ 4.64
Ercc6F8VPZ5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
Ercc6F8VPZ5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC44■■■■■ 4.63
Ercc6F8VPZ5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.99■■■■■ 4.63
Ercc6F8VPZ5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
Ercc6F8VPZ5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
Ercc6F8VPZ5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.63
Ercc6F8VPZ5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC43.94■■■■■ 4.62
Ercc6F8VPZ5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
Ercc6F8VPZ5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
Ercc6F8VPZ5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
Ercc6F8VPZ5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
Ercc6F8VPZ5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC43.89■■■■■ 4.62
Ercc6F8VPZ5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC43.89■■■■■ 4.62
Ercc6F8VPZ5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
Ercc6F8VPZ5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
Ercc6F8VPZ5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC43.87■■■■■ 4.61
Ercc6F8VPZ5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC43.84■■■■■ 4.61
Ercc6F8VPZ5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
Ercc6F8VPZ5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
Ercc6F8VPZ5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
Ercc6F8VPZ5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC43.83■■■■■ 4.61
Ercc6F8VPZ5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.83■■■■■ 4.61
Ercc6F8VPZ5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
Ercc6F8VPZ5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC43.83■■■■■ 4.61
Ercc6F8VPZ5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.6
Ercc6F8VPZ5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC43.81■■■■■ 4.6
Ercc6F8VPZ5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
Ercc6F8VPZ5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
Ercc6F8VPZ5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
Ercc6F8VPZ5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
Ercc6F8VPZ5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
Ercc6F8VPZ5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
Ercc6F8VPZ5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC43.71■■■■■ 4.59
Ercc6F8VPZ5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC43.71■■■■■ 4.59
Ercc6F8VPZ5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC43.71■■■■■ 4.59
Ercc6F8VPZ5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC43.71■■■■■ 4.59
Ercc6F8VPZ5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC43.71■■■■■ 4.59
Ercc6F8VPZ5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC43.68■■■■■ 4.58
Ercc6F8VPZ5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
Ercc6F8VPZ5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC43.67■■■■■ 4.58
Ercc6F8VPZ5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC43.65■■■■■ 4.58
Ercc6F8VPZ5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
Ercc6F8VPZ5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
Ercc6F8VPZ5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
Ercc6F8VPZ5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
Ercc6F8VPZ5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
Ercc6F8VPZ5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
Ercc6F8VPZ5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.56
Ercc6F8VPZ5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
Ercc6F8VPZ5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
Ercc6F8VPZ5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
Ercc6F8VPZ5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
Ercc6F8VPZ5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
Ercc6F8VPZ5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
Ercc6F8VPZ5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
Ercc6F8VPZ5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC43.51■■■■■ 4.56
Ercc6F8VPZ5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
Ercc6F8VPZ5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC43.49■■■■■ 4.55
Ercc6F8VPZ5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
Ercc6F8VPZ5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
Ercc6F8VPZ5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
Ercc6F8VPZ5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC43.48■■■■■ 4.55
Ercc6F8VPZ5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.47■■■■■ 4.55
Ercc6F8VPZ5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC43.47■■■■■ 4.55
Ercc6F8VPZ5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
Ercc6F8VPZ5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC43.45■■■■■ 4.55
Ercc6F8VPZ5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC43.45■■■■■ 4.55
Ercc6F8VPZ5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
Ercc6F8VPZ5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
Ercc6F8VPZ5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC43.45■■■■■ 4.55
Ercc6F8VPZ5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
Ercc6F8VPZ5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
Ercc6F8VPZ5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
Ercc6F8VPZ5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
Ercc6F8VPZ5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
Ercc6F8VPZ5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC43.41■■■■■ 4.54
Ercc6F8VPZ5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC43.4■■■■■ 4.54
Ercc6F8VPZ5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.38■■■■■ 4.54
Ercc6F8VPZ5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC43.38■■■■■ 4.53
Ercc6F8VPZ5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
Ercc6F8VPZ5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
Ercc6F8VPZ5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
Ercc6F8VPZ5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC43.36■■■■■ 4.53
Ercc6F8VPZ5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
Ercc6F8VPZ5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
Ercc6F8VPZ5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
Ercc6F8VPZ5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC43.32■■■■■ 4.53
Ercc6F8VPZ5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms