Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Farp1F8VPU2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Farp1F8VPU2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Farp1F8VPU2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Farp1F8VPU2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Farp1F8VPU2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Farp1F8VPU2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Farp1F8VPU2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Farp1F8VPU2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Farp1F8VPU2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Farp1F8VPU2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Farp1F8VPU2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Farp1F8VPU2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Farp1F8VPU2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Farp1F8VPU2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Farp1F8VPU2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Farp1F8VPU2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Farp1F8VPU2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Farp1F8VPU2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Farp1F8VPU2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Farp1F8VPU2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Farp1F8VPU2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Farp1F8VPU2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Farp1F8VPU2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Farp1F8VPU2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Farp1F8VPU2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Farp1F8VPU2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Farp1F8VPU2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Farp1F8VPU2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Farp1F8VPU2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Farp1F8VPU2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Farp1F8VPU2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Farp1F8VPU2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Farp1F8VPU2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Farp1F8VPU2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Farp1F8VPU2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Farp1F8VPU2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Farp1F8VPU2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Farp1F8VPU2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Farp1F8VPU2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Farp1F8VPU2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Farp1F8VPU2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Farp1F8VPU2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Farp1F8VPU2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Farp1F8VPU2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Farp1F8VPU2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Farp1F8VPU2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Farp1F8VPU2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Farp1F8VPU2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Farp1F8VPU2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Farp1F8VPU2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Farp1F8VPU2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Farp1F8VPU2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Farp1F8VPU2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Farp1F8VPU2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Farp1F8VPU2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Farp1F8VPU2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Farp1F8VPU2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Farp1F8VPU2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Farp1F8VPU2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Farp1F8VPU2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Farp1F8VPU2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Farp1F8VPU2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Farp1F8VPU2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Farp1F8VPU2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Farp1F8VPU2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Farp1F8VPU2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Farp1F8VPU2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Farp1F8VPU2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Farp1F8VPU2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Farp1F8VPU2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Farp1F8VPU2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Farp1F8VPU2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Farp1F8VPU2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Farp1F8VPU2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Farp1F8VPU2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Farp1F8VPU2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Farp1F8VPU2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Farp1F8VPU2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Farp1F8VPU2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Farp1F8VPU2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Farp1F8VPU2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Farp1F8VPU2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Farp1F8VPU2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Farp1F8VPU2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Farp1F8VPU2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Farp1F8VPU2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Farp1F8VPU2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Farp1F8VPU2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Farp1F8VPU2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Farp1F8VPU2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Farp1F8VPU2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Farp1F8VPU2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Farp1F8VPU2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Farp1F8VPU2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Farp1F8VPU2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Farp1F8VPU2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Farp1F8VPU2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Farp1F8VPU2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Farp1F8VPU2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms