Protein–RNA interactions for Protein: F7BCK0

Dcdc2b, Doublecortin domain-containing 2b (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcdc2bF7BCK0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Dcdc2bF7BCK0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Dcdc2bF7BCK0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Dcdc2bF7BCK0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Dcdc2bF7BCK0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Dcdc2bF7BCK0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Dcdc2bF7BCK0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Dcdc2bF7BCK0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Dcdc2bF7BCK0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Dcdc2bF7BCK0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Dcdc2bF7BCK0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Dcdc2bF7BCK0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Dcdc2bF7BCK0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Dcdc2bF7BCK0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Dcdc2bF7BCK0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Dcdc2bF7BCK0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Dcdc2bF7BCK0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Dcdc2bF7BCK0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Dcdc2bF7BCK0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Dcdc2bF7BCK0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Dcdc2bF7BCK0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Dcdc2bF7BCK0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Dcdc2bF7BCK0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Dcdc2bF7BCK0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Dcdc2bF7BCK0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Dcdc2bF7BCK0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Dcdc2bF7BCK0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Dcdc2bF7BCK0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Dcdc2bF7BCK0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Dcdc2bF7BCK0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Dcdc2bF7BCK0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Dcdc2bF7BCK0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Dcdc2bF7BCK0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Dcdc2bF7BCK0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Dcdc2bF7BCK0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Dcdc2bF7BCK0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Dcdc2bF7BCK0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Dcdc2bF7BCK0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Dcdc2bF7BCK0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Dcdc2bF7BCK0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Dcdc2bF7BCK0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Dcdc2bF7BCK0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Dcdc2bF7BCK0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Dcdc2bF7BCK0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Dcdc2bF7BCK0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Dcdc2bF7BCK0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Dcdc2bF7BCK0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Dcdc2bF7BCK0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Dcdc2bF7BCK0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Dcdc2bF7BCK0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Dcdc2bF7BCK0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Dcdc2bF7BCK0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Dcdc2bF7BCK0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Dcdc2bF7BCK0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Dcdc2bF7BCK0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Dcdc2bF7BCK0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Dcdc2bF7BCK0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Dcdc2bF7BCK0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Dcdc2bF7BCK0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Dcdc2bF7BCK0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Dcdc2bF7BCK0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Dcdc2bF7BCK0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Dcdc2bF7BCK0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Dcdc2bF7BCK0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Dcdc2bF7BCK0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Dcdc2bF7BCK0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Dcdc2bF7BCK0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Dcdc2bF7BCK0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Dcdc2bF7BCK0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Dcdc2bF7BCK0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Dcdc2bF7BCK0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Dcdc2bF7BCK0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Dcdc2bF7BCK0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Dcdc2bF7BCK0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Dcdc2bF7BCK0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Dcdc2bF7BCK0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Dcdc2bF7BCK0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Dcdc2bF7BCK0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Dcdc2bF7BCK0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Dcdc2bF7BCK0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Dcdc2bF7BCK0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Dcdc2bF7BCK0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Dcdc2bF7BCK0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Dcdc2bF7BCK0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Dcdc2bF7BCK0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Dcdc2bF7BCK0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Dcdc2bF7BCK0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Dcdc2bF7BCK0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Dcdc2bF7BCK0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Dcdc2bF7BCK0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Dcdc2bF7BCK0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Dcdc2bF7BCK0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Dcdc2bF7BCK0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Dcdc2bF7BCK0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Dcdc2bF7BCK0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Dcdc2bF7BCK0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Dcdc2bF7BCK0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Dcdc2bF7BCK0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Dcdc2bF7BCK0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Dcdc2bF7BCK0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms