Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Igkv1-99F6XWB2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Igkv1-99F6XWB2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Igkv1-99F6XWB2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Igkv1-99F6XWB2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Igkv1-99F6XWB2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Igkv1-99F6XWB2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Igkv1-99F6XWB2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Igkv1-99F6XWB2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Igkv1-99F6XWB2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Igkv1-99F6XWB2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Igkv1-99F6XWB2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Igkv1-99F6XWB2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Igkv1-99F6XWB2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Igkv1-99F6XWB2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Igkv1-99F6XWB2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Igkv1-99F6XWB2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Igkv1-99F6XWB2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Igkv1-99F6XWB2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Igkv1-99F6XWB2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Igkv1-99F6XWB2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Igkv1-99F6XWB2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Igkv1-99F6XWB2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Igkv1-99F6XWB2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Igkv1-99F6XWB2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Igkv1-99F6XWB2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Igkv1-99F6XWB2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Igkv1-99F6XWB2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Igkv1-99F6XWB2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Igkv1-99F6XWB2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Igkv1-99F6XWB2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Igkv1-99F6XWB2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Igkv1-99F6XWB2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Igkv1-99F6XWB2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Igkv1-99F6XWB2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Igkv1-99F6XWB2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Igkv1-99F6XWB2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Igkv1-99F6XWB2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Igkv1-99F6XWB2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Igkv1-99F6XWB2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Igkv1-99F6XWB2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Igkv1-99F6XWB2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Igkv1-99F6XWB2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Igkv1-99F6XWB2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Igkv1-99F6XWB2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Igkv1-99F6XWB2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Igkv1-99F6XWB2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Igkv1-99F6XWB2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Igkv1-99F6XWB2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Igkv1-99F6XWB2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Igkv1-99F6XWB2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Igkv1-99F6XWB2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Igkv1-99F6XWB2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Igkv1-99F6XWB2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Igkv1-99F6XWB2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Igkv1-99F6XWB2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Igkv1-99F6XWB2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Igkv1-99F6XWB2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Igkv1-99F6XWB2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Igkv1-99F6XWB2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Igkv1-99F6XWB2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Igkv1-99F6XWB2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Igkv1-99F6XWB2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Igkv1-99F6XWB2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Igkv1-99F6XWB2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Igkv1-99F6XWB2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Igkv1-99F6XWB2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Igkv1-99F6XWB2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Igkv1-99F6XWB2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Igkv1-99F6XWB2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Igkv1-99F6XWB2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Igkv1-99F6XWB2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Igkv1-99F6XWB2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Igkv1-99F6XWB2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Igkv1-99F6XWB2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Igkv1-99F6XWB2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Igkv1-99F6XWB2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Igkv1-99F6XWB2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Igkv1-99F6XWB2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Igkv1-99F6XWB2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Igkv1-99F6XWB2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Igkv1-99F6XWB2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Igkv1-99F6XWB2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Igkv1-99F6XWB2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Igkv1-99F6XWB2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Igkv1-99F6XWB2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Igkv1-99F6XWB2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Igkv1-99F6XWB2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Igkv1-99F6XWB2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Igkv1-99F6XWB2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Igkv1-99F6XWB2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Igkv1-99F6XWB2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Igkv1-99F6XWB2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Igkv1-99F6XWB2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Igkv1-99F6XWB2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Igkv1-99F6XWB2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Igkv1-99F6XWB2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Igkv1-99F6XWB2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Igkv1-99F6XWB2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Igkv1-99F6XWB2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms