Protein–RNA interactions for Protein: F6SW83

Gm10477, Predicted gene 10477, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10477F6SW83 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm10477F6SW83 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm10477F6SW83 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm10477F6SW83 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm10477F6SW83 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm10477F6SW83 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm10477F6SW83 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm10477F6SW83 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm10477F6SW83 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm10477F6SW83 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm10477F6SW83 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm10477F6SW83 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm10477F6SW83 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm10477F6SW83 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm10477F6SW83 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm10477F6SW83 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm10477F6SW83 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm10477F6SW83 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm10477F6SW83 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm10477F6SW83 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm10477F6SW83 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm10477F6SW83 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm10477F6SW83 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm10477F6SW83 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm10477F6SW83 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm10477F6SW83 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm10477F6SW83 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm10477F6SW83 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm10477F6SW83 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm10477F6SW83 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm10477F6SW83 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm10477F6SW83 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm10477F6SW83 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm10477F6SW83 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm10477F6SW83 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm10477F6SW83 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm10477F6SW83 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm10477F6SW83 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm10477F6SW83 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm10477F6SW83 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm10477F6SW83 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm10477F6SW83 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm10477F6SW83 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm10477F6SW83 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm10477F6SW83 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm10477F6SW83 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm10477F6SW83 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm10477F6SW83 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm10477F6SW83 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm10477F6SW83 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm10477F6SW83 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm10477F6SW83 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm10477F6SW83 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm10477F6SW83 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm10477F6SW83 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm10477F6SW83 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm10477F6SW83 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm10477F6SW83 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm10477F6SW83 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm10477F6SW83 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm10477F6SW83 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm10477F6SW83 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm10477F6SW83 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm10477F6SW83 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm10477F6SW83 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm10477F6SW83 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm10477F6SW83 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gm10477F6SW83 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm10477F6SW83 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm10477F6SW83 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm10477F6SW83 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm10477F6SW83 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm10477F6SW83 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm10477F6SW83 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm10477F6SW83 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm10477F6SW83 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm10477F6SW83 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm10477F6SW83 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm10477F6SW83 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm10477F6SW83 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm10477F6SW83 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm10477F6SW83 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm10477F6SW83 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm10477F6SW83 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm10477F6SW83 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm10477F6SW83 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm10477F6SW83 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm10477F6SW83 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm10477F6SW83 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm10477F6SW83 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm10477F6SW83 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm10477F6SW83 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm10477F6SW83 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm10477F6SW83 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm10477F6SW83 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm10477F6SW83 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm10477F6SW83 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm10477F6SW83 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm10477F6SW83 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm10477F6SW83 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
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