Protein–RNA interactions for Protein: F6QL70

Gm17669, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17669F6QL70 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm17669F6QL70 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm17669F6QL70 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm17669F6QL70 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm17669F6QL70 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm17669F6QL70 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm17669F6QL70 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm17669F6QL70 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm17669F6QL70 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm17669F6QL70 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm17669F6QL70 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm17669F6QL70 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm17669F6QL70 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm17669F6QL70 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm17669F6QL70 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm17669F6QL70 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm17669F6QL70 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm17669F6QL70 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm17669F6QL70 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm17669F6QL70 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm17669F6QL70 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm17669F6QL70 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm17669F6QL70 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm17669F6QL70 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm17669F6QL70 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm17669F6QL70 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm17669F6QL70 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm17669F6QL70 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm17669F6QL70 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm17669F6QL70 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm17669F6QL70 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm17669F6QL70 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm17669F6QL70 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm17669F6QL70 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm17669F6QL70 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm17669F6QL70 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm17669F6QL70 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm17669F6QL70 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm17669F6QL70 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm17669F6QL70 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm17669F6QL70 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm17669F6QL70 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm17669F6QL70 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm17669F6QL70 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm17669F6QL70 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm17669F6QL70 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm17669F6QL70 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm17669F6QL70 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm17669F6QL70 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm17669F6QL70 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm17669F6QL70 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm17669F6QL70 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm17669F6QL70 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm17669F6QL70 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm17669F6QL70 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm17669F6QL70 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm17669F6QL70 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm17669F6QL70 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm17669F6QL70 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm17669F6QL70 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm17669F6QL70 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm17669F6QL70 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Gm17669F6QL70 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm17669F6QL70 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm17669F6QL70 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm17669F6QL70 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm17669F6QL70 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm17669F6QL70 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm17669F6QL70 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm17669F6QL70 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm17669F6QL70 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm17669F6QL70 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm17669F6QL70 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm17669F6QL70 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm17669F6QL70 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm17669F6QL70 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm17669F6QL70 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm17669F6QL70 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm17669F6QL70 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm17669F6QL70 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm17669F6QL70 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm17669F6QL70 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm17669F6QL70 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm17669F6QL70 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm17669F6QL70 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm17669F6QL70 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm17669F6QL70 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm17669F6QL70 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm17669F6QL70 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm17669F6QL70 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm17669F6QL70 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm17669F6QL70 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm17669F6QL70 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm17669F6QL70 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm17669F6QL70 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm17669F6QL70 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm17669F6QL70 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm17669F6QL70 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm17669F6QL70 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm17669F6QL70 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms