Protein–RNA interactions for Protein: E9QLQ1

Defa35, Defensin, alpha, 35, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa35E9QLQ1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Defa35E9QLQ1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Defa35E9QLQ1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Defa35E9QLQ1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Defa35E9QLQ1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Defa35E9QLQ1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Defa35E9QLQ1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Defa35E9QLQ1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Defa35E9QLQ1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Defa35E9QLQ1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Defa35E9QLQ1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Defa35E9QLQ1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Defa35E9QLQ1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Defa35E9QLQ1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa35E9QLQ1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa35E9QLQ1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa35E9QLQ1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa35E9QLQ1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa35E9QLQ1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Defa35E9QLQ1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Defa35E9QLQ1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Defa35E9QLQ1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Defa35E9QLQ1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Defa35E9QLQ1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa35E9QLQ1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa35E9QLQ1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa35E9QLQ1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa35E9QLQ1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa35E9QLQ1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa35E9QLQ1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa35E9QLQ1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa35E9QLQ1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Defa35E9QLQ1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Defa35E9QLQ1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Defa35E9QLQ1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Defa35E9QLQ1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa35E9QLQ1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa35E9QLQ1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa35E9QLQ1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa35E9QLQ1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa35E9QLQ1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa35E9QLQ1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa35E9QLQ1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Defa35E9QLQ1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Defa35E9QLQ1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Defa35E9QLQ1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Defa35E9QLQ1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Defa35E9QLQ1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa35E9QLQ1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa35E9QLQ1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa35E9QLQ1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa35E9QLQ1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa35E9QLQ1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa35E9QLQ1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa35E9QLQ1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa35E9QLQ1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa35E9QLQ1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa35E9QLQ1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa35E9QLQ1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa35E9QLQ1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa35E9QLQ1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa35E9QLQ1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa35E9QLQ1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa35E9QLQ1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa35E9QLQ1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa35E9QLQ1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Defa35E9QLQ1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Defa35E9QLQ1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Defa35E9QLQ1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Defa35E9QLQ1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Defa35E9QLQ1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Defa35E9QLQ1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Defa35E9QLQ1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa35E9QLQ1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa35E9QLQ1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa35E9QLQ1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa35E9QLQ1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa35E9QLQ1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Defa35E9QLQ1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Defa35E9QLQ1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Defa35E9QLQ1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Defa35E9QLQ1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Defa35E9QLQ1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Defa35E9QLQ1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Defa35E9QLQ1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Defa35E9QLQ1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Defa35E9QLQ1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Defa35E9QLQ1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Defa35E9QLQ1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Defa35E9QLQ1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Defa35E9QLQ1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Defa35E9QLQ1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Defa35E9QLQ1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Defa35E9QLQ1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Defa35E9QLQ1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Defa35E9QLQ1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Defa35E9QLQ1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Defa35E9QLQ1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Defa35E9QLQ1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Defa35E9QLQ1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms