Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Lmod3E9QA62 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lmod3E9QA62 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Lmod3E9QA62 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lmod3E9QA62 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lmod3E9QA62 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lmod3E9QA62 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lmod3E9QA62 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lmod3E9QA62 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lmod3E9QA62 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lmod3E9QA62 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lmod3E9QA62 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lmod3E9QA62 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lmod3E9QA62 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lmod3E9QA62 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lmod3E9QA62 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Lmod3E9QA62 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lmod3E9QA62 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lmod3E9QA62 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lmod3E9QA62 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lmod3E9QA62 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lmod3E9QA62 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lmod3E9QA62 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lmod3E9QA62 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Lmod3E9QA62 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lmod3E9QA62 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lmod3E9QA62 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lmod3E9QA62 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Lmod3E9QA62 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Lmod3E9QA62 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lmod3E9QA62 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lmod3E9QA62 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lmod3E9QA62 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lmod3E9QA62 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lmod3E9QA62 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lmod3E9QA62 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lmod3E9QA62 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lmod3E9QA62 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lmod3E9QA62 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lmod3E9QA62 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lmod3E9QA62 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lmod3E9QA62 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lmod3E9QA62 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Lmod3E9QA62 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lmod3E9QA62 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lmod3E9QA62 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lmod3E9QA62 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lmod3E9QA62 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lmod3E9QA62 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lmod3E9QA62 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lmod3E9QA62 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lmod3E9QA62 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lmod3E9QA62 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lmod3E9QA62 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lmod3E9QA62 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lmod3E9QA62 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lmod3E9QA62 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lmod3E9QA62 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lmod3E9QA62 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lmod3E9QA62 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lmod3E9QA62 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lmod3E9QA62 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lmod3E9QA62 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lmod3E9QA62 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lmod3E9QA62 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lmod3E9QA62 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Lmod3E9QA62 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Lmod3E9QA62 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Lmod3E9QA62 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Lmod3E9QA62 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lmod3E9QA62 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lmod3E9QA62 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lmod3E9QA62 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lmod3E9QA62 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lmod3E9QA62 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lmod3E9QA62 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lmod3E9QA62 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lmod3E9QA62 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lmod3E9QA62 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lmod3E9QA62 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lmod3E9QA62 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lmod3E9QA62 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lmod3E9QA62 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lmod3E9QA62 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lmod3E9QA62 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Lmod3E9QA62 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Lmod3E9QA62 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Lmod3E9QA62 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Lmod3E9QA62 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lmod3E9QA62 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lmod3E9QA62 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lmod3E9QA62 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lmod3E9QA62 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lmod3E9QA62 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lmod3E9QA62 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lmod3E9QA62 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lmod3E9QA62 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lmod3E9QA62 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lmod3E9QA62 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lmod3E9QA62 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms