Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6D3

Ccdc121, Coiled-coil domain-containing 121, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc121E9Q6D3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc121E9Q6D3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc121E9Q6D3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc121E9Q6D3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc121E9Q6D3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc121E9Q6D3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc121E9Q6D3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc121E9Q6D3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc121E9Q6D3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc121E9Q6D3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc121E9Q6D3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc121E9Q6D3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc121E9Q6D3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc121E9Q6D3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc121E9Q6D3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc121E9Q6D3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc121E9Q6D3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc121E9Q6D3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc121E9Q6D3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc121E9Q6D3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc121E9Q6D3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc121E9Q6D3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc121E9Q6D3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc121E9Q6D3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc121E9Q6D3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc121E9Q6D3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc121E9Q6D3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc121E9Q6D3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc121E9Q6D3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc121E9Q6D3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc121E9Q6D3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc121E9Q6D3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc121E9Q6D3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc121E9Q6D3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc121E9Q6D3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc121E9Q6D3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc121E9Q6D3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc121E9Q6D3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc121E9Q6D3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc121E9Q6D3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc121E9Q6D3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc121E9Q6D3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc121E9Q6D3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc121E9Q6D3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc121E9Q6D3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc121E9Q6D3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc121E9Q6D3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc121E9Q6D3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc121E9Q6D3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc121E9Q6D3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc121E9Q6D3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc121E9Q6D3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ccdc121E9Q6D3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc121E9Q6D3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc121E9Q6D3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc121E9Q6D3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc121E9Q6D3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc121E9Q6D3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc121E9Q6D3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc121E9Q6D3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc121E9Q6D3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc121E9Q6D3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc121E9Q6D3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc121E9Q6D3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc121E9Q6D3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc121E9Q6D3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc121E9Q6D3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc121E9Q6D3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc121E9Q6D3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc121E9Q6D3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc121E9Q6D3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc121E9Q6D3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc121E9Q6D3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc121E9Q6D3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc121E9Q6D3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc121E9Q6D3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc121E9Q6D3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc121E9Q6D3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc121E9Q6D3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc121E9Q6D3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc121E9Q6D3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc121E9Q6D3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc121E9Q6D3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc121E9Q6D3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc121E9Q6D3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc121E9Q6D3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc121E9Q6D3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc121E9Q6D3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc121E9Q6D3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc121E9Q6D3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc121E9Q6D3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc121E9Q6D3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc121E9Q6D3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc121E9Q6D3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc121E9Q6D3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc121E9Q6D3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc121E9Q6D3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc121E9Q6D3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc121E9Q6D3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc121E9Q6D3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms