Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4Y3

4930546C10Rik, RIKEN cDNA 4930546C10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930546C10RikE9Q4Y3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930546C10RikE9Q4Y3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930546C10RikE9Q4Y3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930546C10RikE9Q4Y3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930546C10RikE9Q4Y3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930546C10RikE9Q4Y3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930546C10RikE9Q4Y3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930546C10RikE9Q4Y3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930546C10RikE9Q4Y3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930546C10RikE9Q4Y3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930546C10RikE9Q4Y3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930546C10RikE9Q4Y3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930546C10RikE9Q4Y3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930546C10RikE9Q4Y3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930546C10RikE9Q4Y3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930546C10RikE9Q4Y3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930546C10RikE9Q4Y3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930546C10RikE9Q4Y3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930546C10RikE9Q4Y3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930546C10RikE9Q4Y3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930546C10RikE9Q4Y3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930546C10RikE9Q4Y3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930546C10RikE9Q4Y3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930546C10RikE9Q4Y3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930546C10RikE9Q4Y3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930546C10RikE9Q4Y3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930546C10RikE9Q4Y3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930546C10RikE9Q4Y3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930546C10RikE9Q4Y3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930546C10RikE9Q4Y3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930546C10RikE9Q4Y3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
4930546C10RikE9Q4Y3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930546C10RikE9Q4Y3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930546C10RikE9Q4Y3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930546C10RikE9Q4Y3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930546C10RikE9Q4Y3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930546C10RikE9Q4Y3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
4930546C10RikE9Q4Y3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930546C10RikE9Q4Y3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930546C10RikE9Q4Y3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930546C10RikE9Q4Y3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930546C10RikE9Q4Y3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930546C10RikE9Q4Y3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930546C10RikE9Q4Y3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930546C10RikE9Q4Y3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930546C10RikE9Q4Y3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930546C10RikE9Q4Y3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930546C10RikE9Q4Y3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930546C10RikE9Q4Y3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930546C10RikE9Q4Y3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930546C10RikE9Q4Y3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930546C10RikE9Q4Y3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930546C10RikE9Q4Y3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
4930546C10RikE9Q4Y3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930546C10RikE9Q4Y3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930546C10RikE9Q4Y3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930546C10RikE9Q4Y3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930546C10RikE9Q4Y3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930546C10RikE9Q4Y3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930546C10RikE9Q4Y3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930546C10RikE9Q4Y3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930546C10RikE9Q4Y3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930546C10RikE9Q4Y3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930546C10RikE9Q4Y3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930546C10RikE9Q4Y3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930546C10RikE9Q4Y3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930546C10RikE9Q4Y3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930546C10RikE9Q4Y3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930546C10RikE9Q4Y3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930546C10RikE9Q4Y3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930546C10RikE9Q4Y3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930546C10RikE9Q4Y3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930546C10RikE9Q4Y3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930546C10RikE9Q4Y3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930546C10RikE9Q4Y3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930546C10RikE9Q4Y3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930546C10RikE9Q4Y3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930546C10RikE9Q4Y3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930546C10RikE9Q4Y3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930546C10RikE9Q4Y3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930546C10RikE9Q4Y3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930546C10RikE9Q4Y3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930546C10RikE9Q4Y3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930546C10RikE9Q4Y3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930546C10RikE9Q4Y3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930546C10RikE9Q4Y3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930546C10RikE9Q4Y3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930546C10RikE9Q4Y3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930546C10RikE9Q4Y3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930546C10RikE9Q4Y3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930546C10RikE9Q4Y3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930546C10RikE9Q4Y3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930546C10RikE9Q4Y3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930546C10RikE9Q4Y3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930546C10RikE9Q4Y3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930546C10RikE9Q4Y3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930546C10RikE9Q4Y3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 224.6 ms