Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1Z0

Krt90, Keratin 90, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt90E9Q1Z0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt90E9Q1Z0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt90E9Q1Z0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt90E9Q1Z0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt90E9Q1Z0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt90E9Q1Z0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt90E9Q1Z0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt90E9Q1Z0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt90E9Q1Z0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt90E9Q1Z0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt90E9Q1Z0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Krt90E9Q1Z0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt90E9Q1Z0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt90E9Q1Z0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt90E9Q1Z0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt90E9Q1Z0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt90E9Q1Z0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt90E9Q1Z0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt90E9Q1Z0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt90E9Q1Z0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt90E9Q1Z0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt90E9Q1Z0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt90E9Q1Z0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt90E9Q1Z0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt90E9Q1Z0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt90E9Q1Z0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt90E9Q1Z0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt90E9Q1Z0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt90E9Q1Z0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt90E9Q1Z0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt90E9Q1Z0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt90E9Q1Z0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt90E9Q1Z0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt90E9Q1Z0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt90E9Q1Z0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt90E9Q1Z0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt90E9Q1Z0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt90E9Q1Z0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt90E9Q1Z0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt90E9Q1Z0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt90E9Q1Z0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt90E9Q1Z0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt90E9Q1Z0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt90E9Q1Z0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt90E9Q1Z0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt90E9Q1Z0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt90E9Q1Z0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt90E9Q1Z0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt90E9Q1Z0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt90E9Q1Z0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt90E9Q1Z0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt90E9Q1Z0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt90E9Q1Z0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt90E9Q1Z0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt90E9Q1Z0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt90E9Q1Z0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt90E9Q1Z0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt90E9Q1Z0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt90E9Q1Z0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt90E9Q1Z0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt90E9Q1Z0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt90E9Q1Z0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt90E9Q1Z0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt90E9Q1Z0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt90E9Q1Z0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt90E9Q1Z0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt90E9Q1Z0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt90E9Q1Z0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt90E9Q1Z0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Krt90E9Q1Z0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Krt90E9Q1Z0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt90E9Q1Z0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt90E9Q1Z0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt90E9Q1Z0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt90E9Q1Z0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt90E9Q1Z0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt90E9Q1Z0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt90E9Q1Z0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt90E9Q1Z0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt90E9Q1Z0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt90E9Q1Z0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt90E9Q1Z0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt90E9Q1Z0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt90E9Q1Z0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt90E9Q1Z0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt90E9Q1Z0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt90E9Q1Z0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt90E9Q1Z0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt90E9Q1Z0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt90E9Q1Z0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt90E9Q1Z0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt90E9Q1Z0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt90E9Q1Z0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt90E9Q1Z0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt90E9Q1Z0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt90E9Q1Z0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt90E9Q1Z0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt90E9Q1Z0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt90E9Q1Z0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt90E9Q1Z0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
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