Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gm20425E9Q035 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gm20425E9Q035 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gm20425E9Q035 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gm20425E9Q035 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gm20425E9Q035 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gm20425E9Q035 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Gm20425E9Q035 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gm20425E9Q035 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Gm20425E9Q035 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Gm20425E9Q035 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gm20425E9Q035 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Gm20425E9Q035 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gm20425E9Q035 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gm20425E9Q035 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gm20425E9Q035 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gm20425E9Q035 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gm20425E9Q035 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gm20425E9Q035 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gm20425E9Q035 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gm20425E9Q035 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gm20425E9Q035 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gm20425E9Q035 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gm20425E9Q035 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gm20425E9Q035 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gm20425E9Q035 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gm20425E9Q035 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gm20425E9Q035 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gm20425E9Q035 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gm20425E9Q035 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Gm20425E9Q035 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gm20425E9Q035 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gm20425E9Q035 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gm20425E9Q035 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gm20425E9Q035 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gm20425E9Q035 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gm20425E9Q035 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gm20425E9Q035 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gm20425E9Q035 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gm20425E9Q035 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gm20425E9Q035 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gm20425E9Q035 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gm20425E9Q035 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Gm20425E9Q035 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gm20425E9Q035 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gm20425E9Q035 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gm20425E9Q035 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gm20425E9Q035 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gm20425E9Q035 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gm20425E9Q035 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gm20425E9Q035 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gm20425E9Q035 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gm20425E9Q035 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Gm20425E9Q035 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gm20425E9Q035 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gm20425E9Q035 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gm20425E9Q035 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gm20425E9Q035 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Gm20425E9Q035 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Gm20425E9Q035 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gm20425E9Q035 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gm20425E9Q035 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gm20425E9Q035 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Gm20425E9Q035 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gm20425E9Q035 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Gm20425E9Q035 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gm20425E9Q035 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gm20425E9Q035 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Gm20425E9Q035 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gm20425E9Q035 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gm20425E9Q035 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gm20425E9Q035 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gm20425E9Q035 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gm20425E9Q035 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gm20425E9Q035 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gm20425E9Q035 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gm20425E9Q035 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gm20425E9Q035 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gm20425E9Q035 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gm20425E9Q035 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gm20425E9Q035 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gm20425E9Q035 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gm20425E9Q035 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gm20425E9Q035 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gm20425E9Q035 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Gm20425E9Q035 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gm20425E9Q035 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gm20425E9Q035 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Gm20425E9Q035 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gm20425E9Q035 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gm20425E9Q035 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gm20425E9Q035 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gm20425E9Q035 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gm20425E9Q035 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gm20425E9Q035 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gm20425E9Q035 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gm20425E9Q035 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28■■■□□ 2.07
Gm20425E9Q035 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gm20425E9Q035 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gm20425E9Q035 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms