Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Chd2E9PZM4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Chd2E9PZM4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Chd2E9PZM4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Chd2E9PZM4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Chd2E9PZM4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Chd2E9PZM4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Chd2E9PZM4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Chd2E9PZM4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Chd2E9PZM4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Chd2E9PZM4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Chd2E9PZM4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Chd2E9PZM4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Chd2E9PZM4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Chd2E9PZM4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Chd2E9PZM4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
Chd2E9PZM4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
Chd2E9PZM4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
Chd2E9PZM4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Chd2E9PZM4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Chd2E9PZM4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Chd2E9PZM4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Chd2E9PZM4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Chd2E9PZM4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Chd2E9PZM4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
Chd2E9PZM4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Chd2E9PZM4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Chd2E9PZM4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Chd2E9PZM4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Chd2E9PZM4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
Chd2E9PZM4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Chd2E9PZM4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Chd2E9PZM4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Chd2E9PZM4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Chd2E9PZM4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Chd2E9PZM4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Chd2E9PZM4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Chd2E9PZM4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Chd2E9PZM4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Chd2E9PZM4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Chd2E9PZM4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Chd2E9PZM4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Chd2E9PZM4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Chd2E9PZM4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Chd2E9PZM4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Chd2E9PZM4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Chd2E9PZM4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
Chd2E9PZM4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Chd2E9PZM4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Chd2E9PZM4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Chd2E9PZM4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Chd2E9PZM4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Chd2E9PZM4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Chd2E9PZM4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Chd2E9PZM4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Chd2E9PZM4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Chd2E9PZM4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Chd2E9PZM4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Chd2E9PZM4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Chd2E9PZM4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Chd2E9PZM4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Chd2E9PZM4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Chd2E9PZM4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Chd2E9PZM4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Chd2E9PZM4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Chd2E9PZM4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Chd2E9PZM4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Chd2E9PZM4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Chd2E9PZM4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Chd2E9PZM4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Chd2E9PZM4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Chd2E9PZM4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Chd2E9PZM4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Chd2E9PZM4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Chd2E9PZM4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Chd2E9PZM4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Chd2E9PZM4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Chd2E9PZM4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Chd2E9PZM4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Chd2E9PZM4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Chd2E9PZM4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Chd2E9PZM4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Chd2E9PZM4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Chd2E9PZM4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Chd2E9PZM4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Chd2E9PZM4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Chd2E9PZM4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
Chd2E9PZM4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.17
Chd2E9PZM4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Chd2E9PZM4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Chd2E9PZM4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Chd2E9PZM4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Chd2E9PZM4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Chd2E9PZM4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Chd2E9PZM4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Chd2E9PZM4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Chd2E9PZM4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Chd2E9PZM4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Chd2E9PZM4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
Chd2E9PZM4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms