Protein–RNA interactions for Protein: E9PW74

Gimd1, GTPase IMAP family member GIMD1, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gimd1E9PW74 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gimd1E9PW74 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gimd1E9PW74 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gimd1E9PW74 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gimd1E9PW74 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gimd1E9PW74 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gimd1E9PW74 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gimd1E9PW74 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gimd1E9PW74 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Gimd1E9PW74 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gimd1E9PW74 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gimd1E9PW74 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gimd1E9PW74 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gimd1E9PW74 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gimd1E9PW74 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gimd1E9PW74 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gimd1E9PW74 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gimd1E9PW74 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gimd1E9PW74 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gimd1E9PW74 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gimd1E9PW74 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Gimd1E9PW74 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gimd1E9PW74 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gimd1E9PW74 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gimd1E9PW74 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gimd1E9PW74 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gimd1E9PW74 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gimd1E9PW74 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gimd1E9PW74 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gimd1E9PW74 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Gimd1E9PW74 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gimd1E9PW74 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gimd1E9PW74 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gimd1E9PW74 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gimd1E9PW74 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gimd1E9PW74 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gimd1E9PW74 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gimd1E9PW74 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gimd1E9PW74 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gimd1E9PW74 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gimd1E9PW74 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gimd1E9PW74 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gimd1E9PW74 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gimd1E9PW74 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gimd1E9PW74 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gimd1E9PW74 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gimd1E9PW74 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gimd1E9PW74 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gimd1E9PW74 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gimd1E9PW74 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gimd1E9PW74 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gimd1E9PW74 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gimd1E9PW74 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gimd1E9PW74 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gimd1E9PW74 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gimd1E9PW74 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gimd1E9PW74 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gimd1E9PW74 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gimd1E9PW74 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gimd1E9PW74 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Gimd1E9PW74 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gimd1E9PW74 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gimd1E9PW74 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gimd1E9PW74 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gimd1E9PW74 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gimd1E9PW74 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gimd1E9PW74 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gimd1E9PW74 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Gimd1E9PW74 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gimd1E9PW74 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gimd1E9PW74 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gimd1E9PW74 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gimd1E9PW74 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gimd1E9PW74 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gimd1E9PW74 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gimd1E9PW74 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gimd1E9PW74 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gimd1E9PW74 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gimd1E9PW74 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gimd1E9PW74 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gimd1E9PW74 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gimd1E9PW74 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gimd1E9PW74 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gimd1E9PW74 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gimd1E9PW74 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gimd1E9PW74 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gimd1E9PW74 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gimd1E9PW74 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gimd1E9PW74 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gimd1E9PW74 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gimd1E9PW74 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gimd1E9PW74 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gimd1E9PW74 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gimd1E9PW74 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gimd1E9PW74 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Gimd1E9PW74 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gimd1E9PW74 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gimd1E9PW74 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gimd1E9PW74 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gimd1E9PW74 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms