Protein–RNA interactions for Protein: E9PUU5

Zfp839, Zinc finger protein 839, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp839E9PUU5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zfp839E9PUU5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zfp839E9PUU5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Zfp839E9PUU5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zfp839E9PUU5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zfp839E9PUU5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zfp839E9PUU5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zfp839E9PUU5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zfp839E9PUU5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zfp839E9PUU5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zfp839E9PUU5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zfp839E9PUU5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zfp839E9PUU5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Zfp839E9PUU5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zfp839E9PUU5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Zfp839E9PUU5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Zfp839E9PUU5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zfp839E9PUU5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zfp839E9PUU5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zfp839E9PUU5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zfp839E9PUU5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zfp839E9PUU5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zfp839E9PUU5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zfp839E9PUU5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zfp839E9PUU5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Zfp839E9PUU5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Zfp839E9PUU5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zfp839E9PUU5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zfp839E9PUU5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zfp839E9PUU5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zfp839E9PUU5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zfp839E9PUU5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zfp839E9PUU5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zfp839E9PUU5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zfp839E9PUU5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zfp839E9PUU5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zfp839E9PUU5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zfp839E9PUU5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Zfp839E9PUU5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zfp839E9PUU5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zfp839E9PUU5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zfp839E9PUU5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zfp839E9PUU5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zfp839E9PUU5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zfp839E9PUU5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zfp839E9PUU5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zfp839E9PUU5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zfp839E9PUU5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Zfp839E9PUU5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Zfp839E9PUU5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Zfp839E9PUU5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zfp839E9PUU5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Zfp839E9PUU5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zfp839E9PUU5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zfp839E9PUU5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zfp839E9PUU5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zfp839E9PUU5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zfp839E9PUU5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Zfp839E9PUU5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zfp839E9PUU5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zfp839E9PUU5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zfp839E9PUU5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zfp839E9PUU5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zfp839E9PUU5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zfp839E9PUU5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zfp839E9PUU5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zfp839E9PUU5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zfp839E9PUU5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Zfp839E9PUU5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Zfp839E9PUU5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Zfp839E9PUU5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zfp839E9PUU5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zfp839E9PUU5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zfp839E9PUU5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zfp839E9PUU5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zfp839E9PUU5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zfp839E9PUU5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zfp839E9PUU5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zfp839E9PUU5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zfp839E9PUU5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zfp839E9PUU5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zfp839E9PUU5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zfp839E9PUU5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zfp839E9PUU5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zfp839E9PUU5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zfp839E9PUU5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zfp839E9PUU5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zfp839E9PUU5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zfp839E9PUU5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zfp839E9PUU5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zfp839E9PUU5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zfp839E9PUU5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zfp839E9PUU5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zfp839E9PUU5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zfp839E9PUU5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zfp839E9PUU5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zfp839E9PUU5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zfp839E9PUU5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zfp839E9PUU5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zfp839E9PUU5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.9 ms