Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL5

Prrt2, Proline-rich transmembrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt2E9PUL5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prrt2E9PUL5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prrt2E9PUL5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Prrt2E9PUL5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prrt2E9PUL5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prrt2E9PUL5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prrt2E9PUL5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prrt2E9PUL5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prrt2E9PUL5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prrt2E9PUL5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prrt2E9PUL5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prrt2E9PUL5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prrt2E9PUL5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prrt2E9PUL5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prrt2E9PUL5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prrt2E9PUL5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prrt2E9PUL5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prrt2E9PUL5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prrt2E9PUL5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prrt2E9PUL5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prrt2E9PUL5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prrt2E9PUL5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prrt2E9PUL5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prrt2E9PUL5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prrt2E9PUL5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Prrt2E9PUL5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prrt2E9PUL5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prrt2E9PUL5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prrt2E9PUL5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prrt2E9PUL5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prrt2E9PUL5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prrt2E9PUL5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prrt2E9PUL5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prrt2E9PUL5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prrt2E9PUL5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prrt2E9PUL5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Prrt2E9PUL5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prrt2E9PUL5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prrt2E9PUL5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prrt2E9PUL5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prrt2E9PUL5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prrt2E9PUL5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prrt2E9PUL5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Prrt2E9PUL5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Prrt2E9PUL5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prrt2E9PUL5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prrt2E9PUL5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prrt2E9PUL5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Prrt2E9PUL5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prrt2E9PUL5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prrt2E9PUL5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prrt2E9PUL5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prrt2E9PUL5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prrt2E9PUL5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prrt2E9PUL5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prrt2E9PUL5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prrt2E9PUL5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prrt2E9PUL5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prrt2E9PUL5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prrt2E9PUL5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prrt2E9PUL5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prrt2E9PUL5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prrt2E9PUL5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Prrt2E9PUL5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prrt2E9PUL5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prrt2E9PUL5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prrt2E9PUL5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prrt2E9PUL5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prrt2E9PUL5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prrt2E9PUL5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prrt2E9PUL5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prrt2E9PUL5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prrt2E9PUL5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prrt2E9PUL5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prrt2E9PUL5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prrt2E9PUL5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prrt2E9PUL5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prrt2E9PUL5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prrt2E9PUL5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Prrt2E9PUL5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prrt2E9PUL5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prrt2E9PUL5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prrt2E9PUL5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prrt2E9PUL5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prrt2E9PUL5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prrt2E9PUL5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prrt2E9PUL5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prrt2E9PUL5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prrt2E9PUL5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prrt2E9PUL5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prrt2E9PUL5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prrt2E9PUL5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prrt2E9PUL5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prrt2E9PUL5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prrt2E9PUL5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prrt2E9PUL5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prrt2E9PUL5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prrt2E9PUL5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prrt2E9PUL5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prrt2E9PUL5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms