Protein–RNA interactions for Protein: E0CXI6

Gm5286, Predicted gene 5286, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5286E0CXI6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm5286E0CXI6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm5286E0CXI6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm5286E0CXI6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm5286E0CXI6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm5286E0CXI6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm5286E0CXI6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm5286E0CXI6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm5286E0CXI6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm5286E0CXI6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm5286E0CXI6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm5286E0CXI6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm5286E0CXI6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm5286E0CXI6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm5286E0CXI6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm5286E0CXI6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm5286E0CXI6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm5286E0CXI6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm5286E0CXI6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm5286E0CXI6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm5286E0CXI6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm5286E0CXI6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm5286E0CXI6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm5286E0CXI6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm5286E0CXI6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm5286E0CXI6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm5286E0CXI6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gm5286E0CXI6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm5286E0CXI6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm5286E0CXI6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm5286E0CXI6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm5286E0CXI6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm5286E0CXI6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm5286E0CXI6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm5286E0CXI6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm5286E0CXI6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm5286E0CXI6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm5286E0CXI6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm5286E0CXI6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm5286E0CXI6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm5286E0CXI6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm5286E0CXI6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm5286E0CXI6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm5286E0CXI6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm5286E0CXI6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm5286E0CXI6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm5286E0CXI6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm5286E0CXI6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm5286E0CXI6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm5286E0CXI6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm5286E0CXI6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm5286E0CXI6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm5286E0CXI6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm5286E0CXI6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm5286E0CXI6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm5286E0CXI6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm5286E0CXI6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm5286E0CXI6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm5286E0CXI6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm5286E0CXI6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm5286E0CXI6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm5286E0CXI6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm5286E0CXI6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm5286E0CXI6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm5286E0CXI6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm5286E0CXI6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm5286E0CXI6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm5286E0CXI6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm5286E0CXI6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm5286E0CXI6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm5286E0CXI6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm5286E0CXI6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm5286E0CXI6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm5286E0CXI6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm5286E0CXI6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm5286E0CXI6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm5286E0CXI6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm5286E0CXI6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm5286E0CXI6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm5286E0CXI6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm5286E0CXI6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm5286E0CXI6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm5286E0CXI6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm5286E0CXI6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm5286E0CXI6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm5286E0CXI6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm5286E0CXI6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm5286E0CXI6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5286E0CXI6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5286E0CXI6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm5286E0CXI6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm5286E0CXI6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm5286E0CXI6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm5286E0CXI6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm5286E0CXI6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm5286E0CXI6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm5286E0CXI6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm5286E0CXI6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5286E0CXI6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5286E0CXI6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms