Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vpreb3D3Z6J4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vpreb3D3Z6J4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vpreb3D3Z6J4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vpreb3D3Z6J4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vpreb3D3Z6J4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Vpreb3D3Z6J4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vpreb3D3Z6J4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vpreb3D3Z6J4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vpreb3D3Z6J4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vpreb3D3Z6J4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vpreb3D3Z6J4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vpreb3D3Z6J4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vpreb3D3Z6J4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vpreb3D3Z6J4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vpreb3D3Z6J4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vpreb3D3Z6J4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vpreb3D3Z6J4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vpreb3D3Z6J4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vpreb3D3Z6J4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vpreb3D3Z6J4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vpreb3D3Z6J4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vpreb3D3Z6J4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vpreb3D3Z6J4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vpreb3D3Z6J4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vpreb3D3Z6J4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vpreb3D3Z6J4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vpreb3D3Z6J4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vpreb3D3Z6J4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vpreb3D3Z6J4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vpreb3D3Z6J4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vpreb3D3Z6J4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Vpreb3D3Z6J4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vpreb3D3Z6J4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vpreb3D3Z6J4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vpreb3D3Z6J4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vpreb3D3Z6J4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vpreb3D3Z6J4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vpreb3D3Z6J4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vpreb3D3Z6J4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vpreb3D3Z6J4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vpreb3D3Z6J4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vpreb3D3Z6J4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vpreb3D3Z6J4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vpreb3D3Z6J4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vpreb3D3Z6J4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vpreb3D3Z6J4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vpreb3D3Z6J4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vpreb3D3Z6J4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vpreb3D3Z6J4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vpreb3D3Z6J4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vpreb3D3Z6J4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vpreb3D3Z6J4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vpreb3D3Z6J4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vpreb3D3Z6J4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vpreb3D3Z6J4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vpreb3D3Z6J4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vpreb3D3Z6J4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vpreb3D3Z6J4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vpreb3D3Z6J4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vpreb3D3Z6J4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vpreb3D3Z6J4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vpreb3D3Z6J4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vpreb3D3Z6J4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vpreb3D3Z6J4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vpreb3D3Z6J4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vpreb3D3Z6J4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vpreb3D3Z6J4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vpreb3D3Z6J4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vpreb3D3Z6J4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vpreb3D3Z6J4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vpreb3D3Z6J4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vpreb3D3Z6J4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vpreb3D3Z6J4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vpreb3D3Z6J4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vpreb3D3Z6J4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vpreb3D3Z6J4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vpreb3D3Z6J4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vpreb3D3Z6J4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vpreb3D3Z6J4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vpreb3D3Z6J4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vpreb3D3Z6J4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vpreb3D3Z6J4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vpreb3D3Z6J4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vpreb3D3Z6J4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vpreb3D3Z6J4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vpreb3D3Z6J4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vpreb3D3Z6J4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vpreb3D3Z6J4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vpreb3D3Z6J4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vpreb3D3Z6J4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vpreb3D3Z6J4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vpreb3D3Z6J4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vpreb3D3Z6J4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vpreb3D3Z6J4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vpreb3D3Z6J4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vpreb3D3Z6J4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vpreb3D3Z6J4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vpreb3D3Z6J4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vpreb3D3Z6J4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.7 ms