Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms