Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1V9

Defa28, Defensin, alpha, 28, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa28D3Z1V9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa28D3Z1V9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa28D3Z1V9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa28D3Z1V9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa28D3Z1V9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa28D3Z1V9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa28D3Z1V9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa28D3Z1V9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa28D3Z1V9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa28D3Z1V9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa28D3Z1V9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa28D3Z1V9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa28D3Z1V9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa28D3Z1V9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa28D3Z1V9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa28D3Z1V9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa28D3Z1V9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa28D3Z1V9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa28D3Z1V9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa28D3Z1V9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa28D3Z1V9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa28D3Z1V9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa28D3Z1V9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa28D3Z1V9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa28D3Z1V9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa28D3Z1V9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa28D3Z1V9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa28D3Z1V9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa28D3Z1V9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defa28D3Z1V9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defa28D3Z1V9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa28D3Z1V9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa28D3Z1V9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa28D3Z1V9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa28D3Z1V9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa28D3Z1V9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa28D3Z1V9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa28D3Z1V9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa28D3Z1V9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa28D3Z1V9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa28D3Z1V9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa28D3Z1V9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa28D3Z1V9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa28D3Z1V9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa28D3Z1V9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa28D3Z1V9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa28D3Z1V9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa28D3Z1V9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa28D3Z1V9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa28D3Z1V9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa28D3Z1V9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa28D3Z1V9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa28D3Z1V9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa28D3Z1V9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa28D3Z1V9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa28D3Z1V9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa28D3Z1V9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa28D3Z1V9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa28D3Z1V9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa28D3Z1V9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa28D3Z1V9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Defa28D3Z1V9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Defa28D3Z1V9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa28D3Z1V9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa28D3Z1V9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa28D3Z1V9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa28D3Z1V9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa28D3Z1V9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa28D3Z1V9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa28D3Z1V9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa28D3Z1V9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa28D3Z1V9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa28D3Z1V9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa28D3Z1V9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa28D3Z1V9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa28D3Z1V9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa28D3Z1V9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa28D3Z1V9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa28D3Z1V9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa28D3Z1V9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa28D3Z1V9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa28D3Z1V9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa28D3Z1V9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa28D3Z1V9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa28D3Z1V9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa28D3Z1V9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa28D3Z1V9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa28D3Z1V9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa28D3Z1V9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Defa28D3Z1V9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa28D3Z1V9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa28D3Z1V9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa28D3Z1V9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa28D3Z1V9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa28D3Z1V9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa28D3Z1V9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa28D3Z1V9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa28D3Z1V9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa28D3Z1V9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa28D3Z1V9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99 ms