Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tgfbr3lD3YZZ2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tgfbr3lD3YZZ2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tgfbr3lD3YZZ2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tgfbr3lD3YZZ2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tgfbr3lD3YZZ2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tgfbr3lD3YZZ2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tgfbr3lD3YZZ2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tgfbr3lD3YZZ2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tgfbr3lD3YZZ2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tgfbr3lD3YZZ2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tgfbr3lD3YZZ2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tgfbr3lD3YZZ2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tgfbr3lD3YZZ2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Tgfbr3lD3YZZ2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tgfbr3lD3YZZ2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tgfbr3lD3YZZ2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tgfbr3lD3YZZ2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tgfbr3lD3YZZ2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tgfbr3lD3YZZ2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Tgfbr3lD3YZZ2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tgfbr3lD3YZZ2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tgfbr3lD3YZZ2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tgfbr3lD3YZZ2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tgfbr3lD3YZZ2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tgfbr3lD3YZZ2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tgfbr3lD3YZZ2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tgfbr3lD3YZZ2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tgfbr3lD3YZZ2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tgfbr3lD3YZZ2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tgfbr3lD3YZZ2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tgfbr3lD3YZZ2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tgfbr3lD3YZZ2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tgfbr3lD3YZZ2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tgfbr3lD3YZZ2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tgfbr3lD3YZZ2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tgfbr3lD3YZZ2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tgfbr3lD3YZZ2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tgfbr3lD3YZZ2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tgfbr3lD3YZZ2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tgfbr3lD3YZZ2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tgfbr3lD3YZZ2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tgfbr3lD3YZZ2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tgfbr3lD3YZZ2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tgfbr3lD3YZZ2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tgfbr3lD3YZZ2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tgfbr3lD3YZZ2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tgfbr3lD3YZZ2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tgfbr3lD3YZZ2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Tgfbr3lD3YZZ2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tgfbr3lD3YZZ2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tgfbr3lD3YZZ2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tgfbr3lD3YZZ2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tgfbr3lD3YZZ2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tgfbr3lD3YZZ2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tgfbr3lD3YZZ2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tgfbr3lD3YZZ2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tgfbr3lD3YZZ2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tgfbr3lD3YZZ2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tgfbr3lD3YZZ2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tgfbr3lD3YZZ2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tgfbr3lD3YZZ2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tgfbr3lD3YZZ2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tgfbr3lD3YZZ2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tgfbr3lD3YZZ2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tgfbr3lD3YZZ2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tgfbr3lD3YZZ2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tgfbr3lD3YZZ2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tgfbr3lD3YZZ2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tgfbr3lD3YZZ2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tgfbr3lD3YZZ2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tgfbr3lD3YZZ2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tgfbr3lD3YZZ2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tgfbr3lD3YZZ2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms