Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc8D3YZV8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc8D3YZV8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc8D3YZV8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc8D3YZV8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc8D3YZV8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc8D3YZV8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc8D3YZV8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc8D3YZV8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc8D3YZV8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc8D3YZV8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc8D3YZV8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc8D3YZV8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc8D3YZV8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc8D3YZV8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc8D3YZV8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc8D3YZV8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc8D3YZV8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc8D3YZV8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc8D3YZV8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc8D3YZV8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc8D3YZV8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc8D3YZV8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc8D3YZV8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc8D3YZV8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc8D3YZV8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc8D3YZV8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc8D3YZV8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc8D3YZV8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc8D3YZV8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc8D3YZV8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc8D3YZV8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc8D3YZV8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc8D3YZV8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc8D3YZV8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc8D3YZV8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc8D3YZV8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc8D3YZV8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc8D3YZV8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc8D3YZV8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc8D3YZV8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc8D3YZV8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc8D3YZV8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc8D3YZV8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc8D3YZV8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc8D3YZV8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc8D3YZV8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc8D3YZV8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc8D3YZV8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc8D3YZV8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc8D3YZV8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc8D3YZV8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc8D3YZV8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc8D3YZV8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc8D3YZV8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc8D3YZV8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc8D3YZV8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc8D3YZV8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc8D3YZV8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc8D3YZV8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc8D3YZV8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc8D3YZV8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc8D3YZV8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc8D3YZV8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc8D3YZV8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc8D3YZV8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc8D3YZV8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc8D3YZV8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc8D3YZV8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc8D3YZV8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc8D3YZV8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc8D3YZV8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc8D3YZV8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc8D3YZV8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc8D3YZV8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc8D3YZV8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc8D3YZV8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc8D3YZV8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc8D3YZV8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc8D3YZV8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc8D3YZV8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc8D3YZV8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc8D3YZV8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc8D3YZV8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc8D3YZV8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc8D3YZV8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc8D3YZV8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc8D3YZV8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc8D3YZV8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc8D3YZV8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc8D3YZV8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc8D3YZV8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc8D3YZV8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc8D3YZV8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc8D3YZV8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc8D3YZV8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc8D3YZV8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc8D3YZV8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc8D3YZV8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc8D3YZV8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms