Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Ccdc6D3YZP9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Ccdc6D3YZP9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Ccdc6D3YZP9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ccdc6D3YZP9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ccdc6D3YZP9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Ccdc6D3YZP9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ccdc6D3YZP9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Ccdc6D3YZP9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Ccdc6D3YZP9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Ccdc6D3YZP9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Ccdc6D3YZP9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ccdc6D3YZP9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ccdc6D3YZP9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ccdc6D3YZP9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ccdc6D3YZP9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ccdc6D3YZP9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ccdc6D3YZP9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ccdc6D3YZP9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ccdc6D3YZP9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ccdc6D3YZP9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ccdc6D3YZP9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ccdc6D3YZP9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ccdc6D3YZP9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ccdc6D3YZP9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ccdc6D3YZP9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ccdc6D3YZP9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ccdc6D3YZP9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ccdc6D3YZP9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ccdc6D3YZP9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ccdc6D3YZP9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ccdc6D3YZP9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Ccdc6D3YZP9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ccdc6D3YZP9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
Ccdc6D3YZP9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
Ccdc6D3YZP9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ccdc6D3YZP9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ccdc6D3YZP9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ccdc6D3YZP9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ccdc6D3YZP9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ccdc6D3YZP9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ccdc6D3YZP9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ccdc6D3YZP9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ccdc6D3YZP9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ccdc6D3YZP9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ccdc6D3YZP9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ccdc6D3YZP9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ccdc6D3YZP9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Ccdc6D3YZP9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ccdc6D3YZP9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Ccdc6D3YZP9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Ccdc6D3YZP9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
Ccdc6D3YZP9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
Ccdc6D3YZP9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Ccdc6D3YZP9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Ccdc6D3YZP9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Ccdc6D3YZP9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Ccdc6D3YZP9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Ccdc6D3YZP9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
Ccdc6D3YZP9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ccdc6D3YZP9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
Ccdc6D3YZP9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Ccdc6D3YZP9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Ccdc6D3YZP9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Ccdc6D3YZP9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Ccdc6D3YZP9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
Ccdc6D3YZP9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Ccdc6D3YZP9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Ccdc6D3YZP9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Ccdc6D3YZP9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Ccdc6D3YZP9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
Ccdc6D3YZP9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Ccdc6D3YZP9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Ccdc6D3YZP9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Ccdc6D3YZP9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Ccdc6D3YZP9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Ccdc6D3YZP9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Ccdc6D3YZP9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
Ccdc6D3YZP9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
Ccdc6D3YZP9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Ccdc6D3YZP9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Ccdc6D3YZP9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Ccdc6D3YZP9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Ccdc6D3YZP9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Ccdc6D3YZP9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Ccdc6D3YZP9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Ccdc6D3YZP9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Ccdc6D3YZP9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ccdc6D3YZP9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Ccdc6D3YZP9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
Ccdc6D3YZP9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Ccdc6D3YZP9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Ccdc6D3YZP9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Ccdc6D3YZP9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Ccdc6D3YZP9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Ccdc6D3YZP9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Ccdc6D3YZP9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Ccdc6D3YZP9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Ccdc6D3YZP9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
Ccdc6D3YZP9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 156.3 ms