Protein–RNA interactions for Protein: C0LLJ0

Kpna7, Importin subunit alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna7C0LLJ0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Kpna7C0LLJ0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kpna7C0LLJ0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kpna7C0LLJ0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kpna7C0LLJ0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kpna7C0LLJ0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kpna7C0LLJ0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kpna7C0LLJ0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kpna7C0LLJ0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kpna7C0LLJ0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kpna7C0LLJ0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kpna7C0LLJ0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kpna7C0LLJ0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kpna7C0LLJ0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kpna7C0LLJ0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kpna7C0LLJ0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kpna7C0LLJ0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kpna7C0LLJ0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kpna7C0LLJ0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kpna7C0LLJ0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kpna7C0LLJ0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kpna7C0LLJ0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kpna7C0LLJ0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kpna7C0LLJ0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kpna7C0LLJ0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kpna7C0LLJ0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kpna7C0LLJ0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kpna7C0LLJ0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Kpna7C0LLJ0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kpna7C0LLJ0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kpna7C0LLJ0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kpna7C0LLJ0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kpna7C0LLJ0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Kpna7C0LLJ0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kpna7C0LLJ0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kpna7C0LLJ0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kpna7C0LLJ0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kpna7C0LLJ0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kpna7C0LLJ0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kpna7C0LLJ0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kpna7C0LLJ0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kpna7C0LLJ0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kpna7C0LLJ0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kpna7C0LLJ0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kpna7C0LLJ0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kpna7C0LLJ0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kpna7C0LLJ0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kpna7C0LLJ0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kpna7C0LLJ0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kpna7C0LLJ0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kpna7C0LLJ0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kpna7C0LLJ0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kpna7C0LLJ0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kpna7C0LLJ0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kpna7C0LLJ0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kpna7C0LLJ0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kpna7C0LLJ0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kpna7C0LLJ0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kpna7C0LLJ0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kpna7C0LLJ0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kpna7C0LLJ0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kpna7C0LLJ0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kpna7C0LLJ0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kpna7C0LLJ0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kpna7C0LLJ0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kpna7C0LLJ0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kpna7C0LLJ0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kpna7C0LLJ0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kpna7C0LLJ0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kpna7C0LLJ0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kpna7C0LLJ0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kpna7C0LLJ0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kpna7C0LLJ0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kpna7C0LLJ0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kpna7C0LLJ0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kpna7C0LLJ0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kpna7C0LLJ0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kpna7C0LLJ0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kpna7C0LLJ0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kpna7C0LLJ0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kpna7C0LLJ0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kpna7C0LLJ0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kpna7C0LLJ0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kpna7C0LLJ0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kpna7C0LLJ0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kpna7C0LLJ0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kpna7C0LLJ0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kpna7C0LLJ0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kpna7C0LLJ0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Kpna7C0LLJ0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kpna7C0LLJ0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kpna7C0LLJ0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Kpna7C0LLJ0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Kpna7C0LLJ0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Kpna7C0LLJ0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Kpna7C0LLJ0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kpna7C0LLJ0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kpna7C0LLJ0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Kpna7C0LLJ0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kpna7C0LLJ0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms