Protein–RNA interactions for Protein: B9EJU1

Gm1141, Gene model 1141, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1141B9EJU1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm1141B9EJU1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm1141B9EJU1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm1141B9EJU1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm1141B9EJU1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm1141B9EJU1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm1141B9EJU1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm1141B9EJU1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm1141B9EJU1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm1141B9EJU1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm1141B9EJU1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm1141B9EJU1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm1141B9EJU1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm1141B9EJU1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm1141B9EJU1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm1141B9EJU1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm1141B9EJU1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm1141B9EJU1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm1141B9EJU1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm1141B9EJU1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm1141B9EJU1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm1141B9EJU1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm1141B9EJU1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm1141B9EJU1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm1141B9EJU1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm1141B9EJU1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm1141B9EJU1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm1141B9EJU1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm1141B9EJU1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm1141B9EJU1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm1141B9EJU1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm1141B9EJU1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm1141B9EJU1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm1141B9EJU1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm1141B9EJU1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm1141B9EJU1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm1141B9EJU1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm1141B9EJU1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm1141B9EJU1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm1141B9EJU1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm1141B9EJU1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm1141B9EJU1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm1141B9EJU1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm1141B9EJU1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm1141B9EJU1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm1141B9EJU1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm1141B9EJU1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm1141B9EJU1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm1141B9EJU1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm1141B9EJU1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm1141B9EJU1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm1141B9EJU1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm1141B9EJU1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm1141B9EJU1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm1141B9EJU1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm1141B9EJU1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm1141B9EJU1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm1141B9EJU1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm1141B9EJU1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm1141B9EJU1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm1141B9EJU1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm1141B9EJU1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm1141B9EJU1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm1141B9EJU1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm1141B9EJU1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm1141B9EJU1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm1141B9EJU1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm1141B9EJU1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm1141B9EJU1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm1141B9EJU1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm1141B9EJU1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm1141B9EJU1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm1141B9EJU1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm1141B9EJU1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm1141B9EJU1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm1141B9EJU1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm1141B9EJU1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm1141B9EJU1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm1141B9EJU1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm1141B9EJU1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm1141B9EJU1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm1141B9EJU1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm1141B9EJU1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm1141B9EJU1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gm1141B9EJU1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gm1141B9EJU1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm1141B9EJU1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm1141B9EJU1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm1141B9EJU1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm1141B9EJU1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm1141B9EJU1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm1141B9EJU1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm1141B9EJU1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm1141B9EJU1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm1141B9EJU1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm1141B9EJU1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm1141B9EJU1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm1141B9EJU1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm1141B9EJU1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm1141B9EJU1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms