Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rd3lB2RV38 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rd3lB2RV38 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rd3lB2RV38 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rd3lB2RV38 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rd3lB2RV38 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rd3lB2RV38 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rd3lB2RV38 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rd3lB2RV38 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rd3lB2RV38 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rd3lB2RV38 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rd3lB2RV38 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rd3lB2RV38 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rd3lB2RV38 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rd3lB2RV38 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rd3lB2RV38 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rd3lB2RV38 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rd3lB2RV38 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rd3lB2RV38 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rd3lB2RV38 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rd3lB2RV38 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rd3lB2RV38 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rd3lB2RV38 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rd3lB2RV38 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rd3lB2RV38 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rd3lB2RV38 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rd3lB2RV38 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rd3lB2RV38 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rd3lB2RV38 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rd3lB2RV38 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Rd3lB2RV38 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rd3lB2RV38 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rd3lB2RV38 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Rd3lB2RV38 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rd3lB2RV38 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rd3lB2RV38 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rd3lB2RV38 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rd3lB2RV38 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rd3lB2RV38 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rd3lB2RV38 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rd3lB2RV38 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rd3lB2RV38 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rd3lB2RV38 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rd3lB2RV38 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rd3lB2RV38 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rd3lB2RV38 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rd3lB2RV38 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rd3lB2RV38 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rd3lB2RV38 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rd3lB2RV38 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rd3lB2RV38 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rd3lB2RV38 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rd3lB2RV38 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rd3lB2RV38 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rd3lB2RV38 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rd3lB2RV38 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rd3lB2RV38 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rd3lB2RV38 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rd3lB2RV38 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rd3lB2RV38 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rd3lB2RV38 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rd3lB2RV38 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rd3lB2RV38 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rd3lB2RV38 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rd3lB2RV38 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Rd3lB2RV38 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rd3lB2RV38 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rd3lB2RV38 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rd3lB2RV38 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rd3lB2RV38 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rd3lB2RV38 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rd3lB2RV38 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rd3lB2RV38 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rd3lB2RV38 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rd3lB2RV38 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rd3lB2RV38 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rd3lB2RV38 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rd3lB2RV38 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rd3lB2RV38 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rd3lB2RV38 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rd3lB2RV38 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rd3lB2RV38 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rd3lB2RV38 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rd3lB2RV38 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rd3lB2RV38 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rd3lB2RV38 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rd3lB2RV38 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rd3lB2RV38 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rd3lB2RV38 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rd3lB2RV38 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rd3lB2RV38 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rd3lB2RV38 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rd3lB2RV38 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rd3lB2RV38 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rd3lB2RV38 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rd3lB2RV38 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rd3lB2RV38 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rd3lB2RV38 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rd3lB2RV38 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rd3lB2RV38 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms