Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AU015836B2RUM3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AU015836B2RUM3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AU015836B2RUM3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AU015836B2RUM3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
AU015836B2RUM3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AU015836B2RUM3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
AU015836B2RUM3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
AU015836B2RUM3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
AU015836B2RUM3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
AU015836B2RUM3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
AU015836B2RUM3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
AU015836B2RUM3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
AU015836B2RUM3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
AU015836B2RUM3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
AU015836B2RUM3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
AU015836B2RUM3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
AU015836B2RUM3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
AU015836B2RUM3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
AU015836B2RUM3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
AU015836B2RUM3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
AU015836B2RUM3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
AU015836B2RUM3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
AU015836B2RUM3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
AU015836B2RUM3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
AU015836B2RUM3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
AU015836B2RUM3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
AU015836B2RUM3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
AU015836B2RUM3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
AU015836B2RUM3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
AU015836B2RUM3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
AU015836B2RUM3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
AU015836B2RUM3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
AU015836B2RUM3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
AU015836B2RUM3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
AU015836B2RUM3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
AU015836B2RUM3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
AU015836B2RUM3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
AU015836B2RUM3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
AU015836B2RUM3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
AU015836B2RUM3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
AU015836B2RUM3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
AU015836B2RUM3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
AU015836B2RUM3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
AU015836B2RUM3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
AU015836B2RUM3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
AU015836B2RUM3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
AU015836B2RUM3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
AU015836B2RUM3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
AU015836B2RUM3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
AU015836B2RUM3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
AU015836B2RUM3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
AU015836B2RUM3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
AU015836B2RUM3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
AU015836B2RUM3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
AU015836B2RUM3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
AU015836B2RUM3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
AU015836B2RUM3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
AU015836B2RUM3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
AU015836B2RUM3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
AU015836B2RUM3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
AU015836B2RUM3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
AU015836B2RUM3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
AU015836B2RUM3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
AU015836B2RUM3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
AU015836B2RUM3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
AU015836B2RUM3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
AU015836B2RUM3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
AU015836B2RUM3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
AU015836B2RUM3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
AU015836B2RUM3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
AU015836B2RUM3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
AU015836B2RUM3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
AU015836B2RUM3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
AU015836B2RUM3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
AU015836B2RUM3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
AU015836B2RUM3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
AU015836B2RUM3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
AU015836B2RUM3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
AU015836B2RUM3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
AU015836B2RUM3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
AU015836B2RUM3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
AU015836B2RUM3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
AU015836B2RUM3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
AU015836B2RUM3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
AU015836B2RUM3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
AU015836B2RUM3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
AU015836B2RUM3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
AU015836B2RUM3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
AU015836B2RUM3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
AU015836B2RUM3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
AU015836B2RUM3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
AU015836B2RUM3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
AU015836B2RUM3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
AU015836B2RUM3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
AU015836B2RUM3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
AU015836B2RUM3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
AU015836B2RUM3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
AU015836B2RUM3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
AU015836B2RUM3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.2 ms