Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Apba1B2RUJ5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Apba1B2RUJ5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Apba1B2RUJ5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Apba1B2RUJ5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Apba1B2RUJ5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Apba1B2RUJ5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Apba1B2RUJ5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Apba1B2RUJ5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Apba1B2RUJ5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Apba1B2RUJ5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Apba1B2RUJ5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Apba1B2RUJ5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Apba1B2RUJ5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Apba1B2RUJ5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Apba1B2RUJ5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Apba1B2RUJ5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Apba1B2RUJ5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Apba1B2RUJ5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Apba1B2RUJ5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Apba1B2RUJ5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Apba1B2RUJ5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Apba1B2RUJ5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Apba1B2RUJ5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Apba1B2RUJ5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Apba1B2RUJ5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Apba1B2RUJ5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Apba1B2RUJ5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Apba1B2RUJ5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Apba1B2RUJ5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Apba1B2RUJ5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Apba1B2RUJ5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Apba1B2RUJ5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Apba1B2RUJ5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Apba1B2RUJ5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Apba1B2RUJ5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Apba1B2RUJ5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Apba1B2RUJ5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Apba1B2RUJ5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Apba1B2RUJ5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Apba1B2RUJ5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Apba1B2RUJ5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Apba1B2RUJ5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Apba1B2RUJ5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Apba1B2RUJ5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Apba1B2RUJ5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Apba1B2RUJ5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Apba1B2RUJ5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Apba1B2RUJ5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Apba1B2RUJ5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Apba1B2RUJ5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Apba1B2RUJ5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Apba1B2RUJ5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Apba1B2RUJ5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Apba1B2RUJ5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Apba1B2RUJ5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Apba1B2RUJ5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Apba1B2RUJ5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Apba1B2RUJ5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Apba1B2RUJ5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Apba1B2RUJ5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Apba1B2RUJ5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Apba1B2RUJ5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Apba1B2RUJ5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Apba1B2RUJ5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Apba1B2RUJ5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Apba1B2RUJ5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Apba1B2RUJ5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Apba1B2RUJ5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Apba1B2RUJ5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Apba1B2RUJ5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Apba1B2RUJ5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Apba1B2RUJ5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Apba1B2RUJ5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Apba1B2RUJ5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Apba1B2RUJ5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Apba1B2RUJ5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Apba1B2RUJ5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Apba1B2RUJ5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Apba1B2RUJ5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Apba1B2RUJ5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Apba1B2RUJ5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Apba1B2RUJ5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Apba1B2RUJ5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Apba1B2RUJ5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Apba1B2RUJ5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Apba1B2RUJ5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Apba1B2RUJ5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Apba1B2RUJ5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Apba1B2RUJ5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Apba1B2RUJ5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Apba1B2RUJ5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Apba1B2RUJ5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Apba1B2RUJ5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Apba1B2RUJ5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Apba1B2RUJ5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Apba1B2RUJ5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Apba1B2RUJ5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Apba1B2RUJ5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Apba1B2RUJ5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122 ms