Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Otud4B2RRE7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Otud4B2RRE7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Otud4B2RRE7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Otud4B2RRE7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Otud4B2RRE7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Otud4B2RRE7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Otud4B2RRE7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Otud4B2RRE7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Otud4B2RRE7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Otud4B2RRE7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Otud4B2RRE7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Otud4B2RRE7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Otud4B2RRE7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Otud4B2RRE7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Otud4B2RRE7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Otud4B2RRE7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Otud4B2RRE7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Otud4B2RRE7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Otud4B2RRE7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Otud4B2RRE7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Otud4B2RRE7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Otud4B2RRE7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Otud4B2RRE7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Otud4B2RRE7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Otud4B2RRE7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Otud4B2RRE7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Otud4B2RRE7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Otud4B2RRE7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Otud4B2RRE7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Otud4B2RRE7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Otud4B2RRE7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Otud4B2RRE7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Otud4B2RRE7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Otud4B2RRE7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Otud4B2RRE7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Otud4B2RRE7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Otud4B2RRE7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Otud4B2RRE7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Otud4B2RRE7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Otud4B2RRE7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Otud4B2RRE7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Otud4B2RRE7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Otud4B2RRE7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Otud4B2RRE7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Otud4B2RRE7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Otud4B2RRE7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Otud4B2RRE7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Otud4B2RRE7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Otud4B2RRE7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Otud4B2RRE7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Otud4B2RRE7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Otud4B2RRE7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Otud4B2RRE7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Otud4B2RRE7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Otud4B2RRE7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Otud4B2RRE7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Otud4B2RRE7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Otud4B2RRE7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Otud4B2RRE7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Otud4B2RRE7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Otud4B2RRE7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Otud4B2RRE7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Otud4B2RRE7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Otud4B2RRE7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Otud4B2RRE7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Otud4B2RRE7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Otud4B2RRE7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Otud4B2RRE7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Otud4B2RRE7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Otud4B2RRE7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Otud4B2RRE7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Otud4B2RRE7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Otud4B2RRE7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Otud4B2RRE7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Otud4B2RRE7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Otud4B2RRE7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Otud4B2RRE7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Otud4B2RRE7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Otud4B2RRE7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Otud4B2RRE7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Otud4B2RRE7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Otud4B2RRE7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Otud4B2RRE7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Otud4B2RRE7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Otud4B2RRE7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Otud4B2RRE7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Otud4B2RRE7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Otud4B2RRE7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Otud4B2RRE7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Otud4B2RRE7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Otud4B2RRE7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Otud4B2RRE7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Otud4B2RRE7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Otud4B2RRE7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Otud4B2RRE7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Otud4B2RRE7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Otud4B2RRE7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Otud4B2RRE7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Otud4B2RRE7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms