Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC39.11■■■■□ 3.85
Ythdc2B2RR83 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
Ythdc2B2RR83 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Ythdc2B2RR83 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
Ythdc2B2RR83 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
Ythdc2B2RR83 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
Ythdc2B2RR83 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
Ythdc2B2RR83 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
Ythdc2B2RR83 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
Ythdc2B2RR83 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Ythdc2B2RR83 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
Ythdc2B2RR83 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
Ythdc2B2RR83 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Ythdc2B2RR83 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Ythdc2B2RR83 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Ythdc2B2RR83 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Ythdc2B2RR83 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Ythdc2B2RR83 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Ythdc2B2RR83 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Ythdc2B2RR83 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC38.98■■■■□ 3.83
Ythdc2B2RR83 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
Ythdc2B2RR83 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
Ythdc2B2RR83 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Ythdc2B2RR83 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
Ythdc2B2RR83 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
Ythdc2B2RR83 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC38.96■■■■□ 3.83
Ythdc2B2RR83 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Ythdc2B2RR83 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
Ythdc2B2RR83 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
Ythdc2B2RR83 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Ythdc2B2RR83 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Ythdc2B2RR83 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Ythdc2B2RR83 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC38.93■■■■□ 3.82
Ythdc2B2RR83 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC38.93■■■■□ 3.82
Ythdc2B2RR83 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Ythdc2B2RR83 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Ythdc2B2RR83 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Ythdc2B2RR83 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC38.88■■■■□ 3.81
Ythdc2B2RR83 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Ythdc2B2RR83 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
Ythdc2B2RR83 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
Ythdc2B2RR83 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
Ythdc2B2RR83 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
Ythdc2B2RR83 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
Ythdc2B2RR83 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Ythdc2B2RR83 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
Ythdc2B2RR83 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Ythdc2B2RR83 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC38.79■■■■□ 3.8
Ythdc2B2RR83 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Ythdc2B2RR83 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
Ythdc2B2RR83 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Ythdc2B2RR83 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Ythdc2B2RR83 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Ythdc2B2RR83 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Ythdc2B2RR83 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
Ythdc2B2RR83 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Ythdc2B2RR83 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Ythdc2B2RR83 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Ythdc2B2RR83 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
Ythdc2B2RR83 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Ythdc2B2RR83 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Ythdc2B2RR83 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Ythdc2B2RR83 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Ythdc2B2RR83 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
Ythdc2B2RR83 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Ythdc2B2RR83 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
Ythdc2B2RR83 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
Ythdc2B2RR83 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Ythdc2B2RR83 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC38.59■■■■□ 3.77
Ythdc2B2RR83 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
Ythdc2B2RR83 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Ythdc2B2RR83 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC38.55■■■■□ 3.76
Ythdc2B2RR83 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Ythdc2B2RR83 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
Ythdc2B2RR83 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
Ythdc2B2RR83 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
Ythdc2B2RR83 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Ythdc2B2RR83 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
Ythdc2B2RR83 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Ythdc2B2RR83 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Ythdc2B2RR83 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Ythdc2B2RR83 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Ythdc2B2RR83 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
Ythdc2B2RR83 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Ythdc2B2RR83 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Ythdc2B2RR83 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
Ythdc2B2RR83 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Ythdc2B2RR83 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Ythdc2B2RR83 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
Ythdc2B2RR83 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
Ythdc2B2RR83 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
Ythdc2B2RR83 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Ythdc2B2RR83 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC38.46■■■■□ 3.75
Ythdc2B2RR83 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Ythdc2B2RR83 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Ythdc2B2RR83 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Ythdc2B2RR83 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Ythdc2B2RR83 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Ythdc2B2RR83 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Ythdc2B2RR83 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms