Protein–RNA interactions for Protein: B2RQY6

BC035947, BC035947 protein, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035947B2RQY6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BC035947B2RQY6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BC035947B2RQY6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BC035947B2RQY6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BC035947B2RQY6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BC035947B2RQY6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BC035947B2RQY6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BC035947B2RQY6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BC035947B2RQY6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BC035947B2RQY6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BC035947B2RQY6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BC035947B2RQY6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BC035947B2RQY6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BC035947B2RQY6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BC035947B2RQY6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BC035947B2RQY6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BC035947B2RQY6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BC035947B2RQY6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BC035947B2RQY6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BC035947B2RQY6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BC035947B2RQY6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BC035947B2RQY6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BC035947B2RQY6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BC035947B2RQY6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BC035947B2RQY6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BC035947B2RQY6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BC035947B2RQY6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BC035947B2RQY6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BC035947B2RQY6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BC035947B2RQY6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BC035947B2RQY6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BC035947B2RQY6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BC035947B2RQY6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BC035947B2RQY6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BC035947B2RQY6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BC035947B2RQY6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BC035947B2RQY6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BC035947B2RQY6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BC035947B2RQY6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BC035947B2RQY6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BC035947B2RQY6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BC035947B2RQY6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BC035947B2RQY6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BC035947B2RQY6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BC035947B2RQY6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BC035947B2RQY6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BC035947B2RQY6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BC035947B2RQY6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BC035947B2RQY6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BC035947B2RQY6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BC035947B2RQY6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BC035947B2RQY6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BC035947B2RQY6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BC035947B2RQY6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BC035947B2RQY6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BC035947B2RQY6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BC035947B2RQY6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BC035947B2RQY6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BC035947B2RQY6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BC035947B2RQY6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BC035947B2RQY6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BC035947B2RQY6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BC035947B2RQY6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BC035947B2RQY6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BC035947B2RQY6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BC035947B2RQY6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BC035947B2RQY6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BC035947B2RQY6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BC035947B2RQY6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BC035947B2RQY6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BC035947B2RQY6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BC035947B2RQY6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BC035947B2RQY6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BC035947B2RQY6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BC035947B2RQY6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BC035947B2RQY6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BC035947B2RQY6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BC035947B2RQY6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BC035947B2RQY6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BC035947B2RQY6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BC035947B2RQY6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BC035947B2RQY6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BC035947B2RQY6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BC035947B2RQY6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BC035947B2RQY6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BC035947B2RQY6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BC035947B2RQY6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BC035947B2RQY6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BC035947B2RQY6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BC035947B2RQY6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BC035947B2RQY6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BC035947B2RQY6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BC035947B2RQY6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
BC035947B2RQY6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BC035947B2RQY6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BC035947B2RQY6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BC035947B2RQY6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BC035947B2RQY6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BC035947B2RQY6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BC035947B2RQY6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms