Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Spocd1B1ASB6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Spocd1B1ASB6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Spocd1B1ASB6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Spocd1B1ASB6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Spocd1B1ASB6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Spocd1B1ASB6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Spocd1B1ASB6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Spocd1B1ASB6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Spocd1B1ASB6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Spocd1B1ASB6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Spocd1B1ASB6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Spocd1B1ASB6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Spocd1B1ASB6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Spocd1B1ASB6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Spocd1B1ASB6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Spocd1B1ASB6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Spocd1B1ASB6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Spocd1B1ASB6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Spocd1B1ASB6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Spocd1B1ASB6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Spocd1B1ASB6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Spocd1B1ASB6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Spocd1B1ASB6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Spocd1B1ASB6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Spocd1B1ASB6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Spocd1B1ASB6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Spocd1B1ASB6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Spocd1B1ASB6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Spocd1B1ASB6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Spocd1B1ASB6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Spocd1B1ASB6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Spocd1B1ASB6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Spocd1B1ASB6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Spocd1B1ASB6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Spocd1B1ASB6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Spocd1B1ASB6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Spocd1B1ASB6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Spocd1B1ASB6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Spocd1B1ASB6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Spocd1B1ASB6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Spocd1B1ASB6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Spocd1B1ASB6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Spocd1B1ASB6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Spocd1B1ASB6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Spocd1B1ASB6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Spocd1B1ASB6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Spocd1B1ASB6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Spocd1B1ASB6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Spocd1B1ASB6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Spocd1B1ASB6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Spocd1B1ASB6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Spocd1B1ASB6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Spocd1B1ASB6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Spocd1B1ASB6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Spocd1B1ASB6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Spocd1B1ASB6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Spocd1B1ASB6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Spocd1B1ASB6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Spocd1B1ASB6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Spocd1B1ASB6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Spocd1B1ASB6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Spocd1B1ASB6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Spocd1B1ASB6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Spocd1B1ASB6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Spocd1B1ASB6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Spocd1B1ASB6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Spocd1B1ASB6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Spocd1B1ASB6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Spocd1B1ASB6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Spocd1B1ASB6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Spocd1B1ASB6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Spocd1B1ASB6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Spocd1B1ASB6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Spocd1B1ASB6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Spocd1B1ASB6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Spocd1B1ASB6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Spocd1B1ASB6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Spocd1B1ASB6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Spocd1B1ASB6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Spocd1B1ASB6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Spocd1B1ASB6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Spocd1B1ASB6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Spocd1B1ASB6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Spocd1B1ASB6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Spocd1B1ASB6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Spocd1B1ASB6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Spocd1B1ASB6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Spocd1B1ASB6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Spocd1B1ASB6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Spocd1B1ASB6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Spocd1B1ASB6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Spocd1B1ASB6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Spocd1B1ASB6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Spocd1B1ASB6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Spocd1B1ASB6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Spocd1B1ASB6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Spocd1B1ASB6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Spocd1B1ASB6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Spocd1B1ASB6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms