Protein–RNA interactions for Protein: A7TZF3

Skint4, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint4A7TZF3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Skint4A7TZF3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Skint4A7TZF3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Skint4A7TZF3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Skint4A7TZF3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Skint4A7TZF3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Skint4A7TZF3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Skint4A7TZF3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Skint4A7TZF3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Skint4A7TZF3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Skint4A7TZF3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Skint4A7TZF3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Skint4A7TZF3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Skint4A7TZF3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Skint4A7TZF3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Skint4A7TZF3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Skint4A7TZF3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Skint4A7TZF3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Skint4A7TZF3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Skint4A7TZF3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Skint4A7TZF3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Skint4A7TZF3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Skint4A7TZF3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Skint4A7TZF3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Skint4A7TZF3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Skint4A7TZF3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Skint4A7TZF3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Skint4A7TZF3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Skint4A7TZF3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Skint4A7TZF3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Skint4A7TZF3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Skint4A7TZF3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Skint4A7TZF3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Skint4A7TZF3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Skint4A7TZF3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Skint4A7TZF3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Skint4A7TZF3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Skint4A7TZF3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Skint4A7TZF3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Skint4A7TZF3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Skint4A7TZF3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Skint4A7TZF3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Skint4A7TZF3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Skint4A7TZF3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Skint4A7TZF3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Skint4A7TZF3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Skint4A7TZF3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Skint4A7TZF3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Skint4A7TZF3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Skint4A7TZF3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Skint4A7TZF3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Skint4A7TZF3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Skint4A7TZF3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Skint4A7TZF3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Skint4A7TZF3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Skint4A7TZF3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Skint4A7TZF3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Skint4A7TZF3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Skint4A7TZF3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Skint4A7TZF3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Skint4A7TZF3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Skint4A7TZF3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Skint4A7TZF3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Skint4A7TZF3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Skint4A7TZF3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Skint4A7TZF3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Skint4A7TZF3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Skint4A7TZF3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Skint4A7TZF3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Skint4A7TZF3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Skint4A7TZF3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Skint4A7TZF3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Skint4A7TZF3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Skint4A7TZF3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Skint4A7TZF3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.31■■□□□ 1
Skint4A7TZF3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Skint4A7TZF3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Skint4A7TZF3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Skint4A7TZF3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Skint4A7TZF3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Skint4A7TZF3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Skint4A7TZF3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Skint4A7TZF3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Skint4A7TZF3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Skint4A7TZF3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Skint4A7TZF3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Skint4A7TZF3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Skint4A7TZF3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Skint4A7TZF3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Skint4A7TZF3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Skint4A7TZF3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Skint4A7TZF3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Skint4A7TZF3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Skint4A7TZF3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Skint4A7TZF3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Skint4A7TZF3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Skint4A7TZF3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Skint4A7TZF3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Skint4A7TZF3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Skint4A7TZF3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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