Protein–RNA interactions for Protein: A2AJK6

Chd7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd7A2AJK6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chd7A2AJK6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chd7A2AJK6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chd7A2AJK6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chd7A2AJK6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chd7A2AJK6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chd7A2AJK6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chd7A2AJK6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chd7A2AJK6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chd7A2AJK6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chd7A2AJK6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chd7A2AJK6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Chd7A2AJK6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chd7A2AJK6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chd7A2AJK6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chd7A2AJK6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chd7A2AJK6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chd7A2AJK6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Chd7A2AJK6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chd7A2AJK6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chd7A2AJK6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chd7A2AJK6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chd7A2AJK6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chd7A2AJK6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chd7A2AJK6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chd7A2AJK6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chd7A2AJK6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chd7A2AJK6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Chd7A2AJK6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chd7A2AJK6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chd7A2AJK6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Chd7A2AJK6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chd7A2AJK6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chd7A2AJK6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chd7A2AJK6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chd7A2AJK6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chd7A2AJK6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Chd7A2AJK6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Chd7A2AJK6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chd7A2AJK6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chd7A2AJK6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chd7A2AJK6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chd7A2AJK6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chd7A2AJK6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chd7A2AJK6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd7A2AJK6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chd7A2AJK6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chd7A2AJK6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chd7A2AJK6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Chd7A2AJK6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chd7A2AJK6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chd7A2AJK6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chd7A2AJK6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chd7A2AJK6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chd7A2AJK6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chd7A2AJK6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chd7A2AJK6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chd7A2AJK6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Chd7A2AJK6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chd7A2AJK6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chd7A2AJK6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chd7A2AJK6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chd7A2AJK6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chd7A2AJK6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chd7A2AJK6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chd7A2AJK6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chd7A2AJK6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chd7A2AJK6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chd7A2AJK6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chd7A2AJK6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Chd7A2AJK6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chd7A2AJK6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chd7A2AJK6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chd7A2AJK6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chd7A2AJK6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chd7A2AJK6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chd7A2AJK6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chd7A2AJK6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chd7A2AJK6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chd7A2AJK6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chd7A2AJK6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chd7A2AJK6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chd7A2AJK6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chd7A2AJK6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chd7A2AJK6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chd7A2AJK6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chd7A2AJK6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chd7A2AJK6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chd7A2AJK6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chd7A2AJK6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chd7A2AJK6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Chd7A2AJK6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Chd7A2AJK6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chd7A2AJK6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chd7A2AJK6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Chd7A2AJK6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Chd7A2AJK6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chd7A2AJK6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Chd7A2AJK6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Chd7A2AJK6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms