Protein–RNA interactions for Protein: A2AIW0

Sdccag3, Serologically defined colon cancer antigen 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdccag3A2AIW0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sdccag3A2AIW0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sdccag3A2AIW0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sdccag3A2AIW0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sdccag3A2AIW0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sdccag3A2AIW0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Sdccag3A2AIW0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sdccag3A2AIW0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sdccag3A2AIW0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sdccag3A2AIW0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sdccag3A2AIW0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sdccag3A2AIW0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sdccag3A2AIW0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sdccag3A2AIW0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sdccag3A2AIW0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sdccag3A2AIW0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sdccag3A2AIW0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sdccag3A2AIW0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sdccag3A2AIW0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Sdccag3A2AIW0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sdccag3A2AIW0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sdccag3A2AIW0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sdccag3A2AIW0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sdccag3A2AIW0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Sdccag3A2AIW0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sdccag3A2AIW0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sdccag3A2AIW0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sdccag3A2AIW0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sdccag3A2AIW0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sdccag3A2AIW0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sdccag3A2AIW0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sdccag3A2AIW0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sdccag3A2AIW0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sdccag3A2AIW0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sdccag3A2AIW0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sdccag3A2AIW0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sdccag3A2AIW0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sdccag3A2AIW0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sdccag3A2AIW0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sdccag3A2AIW0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Sdccag3A2AIW0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sdccag3A2AIW0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sdccag3A2AIW0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sdccag3A2AIW0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sdccag3A2AIW0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sdccag3A2AIW0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sdccag3A2AIW0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sdccag3A2AIW0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sdccag3A2AIW0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sdccag3A2AIW0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sdccag3A2AIW0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sdccag3A2AIW0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sdccag3A2AIW0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sdccag3A2AIW0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sdccag3A2AIW0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sdccag3A2AIW0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sdccag3A2AIW0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sdccag3A2AIW0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sdccag3A2AIW0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sdccag3A2AIW0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sdccag3A2AIW0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sdccag3A2AIW0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sdccag3A2AIW0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sdccag3A2AIW0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sdccag3A2AIW0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sdccag3A2AIW0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sdccag3A2AIW0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sdccag3A2AIW0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sdccag3A2AIW0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sdccag3A2AIW0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sdccag3A2AIW0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sdccag3A2AIW0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sdccag3A2AIW0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sdccag3A2AIW0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sdccag3A2AIW0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sdccag3A2AIW0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sdccag3A2AIW0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sdccag3A2AIW0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sdccag3A2AIW0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sdccag3A2AIW0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sdccag3A2AIW0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sdccag3A2AIW0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sdccag3A2AIW0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sdccag3A2AIW0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sdccag3A2AIW0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sdccag3A2AIW0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sdccag3A2AIW0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sdccag3A2AIW0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sdccag3A2AIW0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sdccag3A2AIW0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sdccag3A2AIW0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sdccag3A2AIW0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sdccag3A2AIW0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sdccag3A2AIW0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sdccag3A2AIW0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sdccag3A2AIW0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sdccag3A2AIW0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sdccag3A2AIW0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sdccag3A2AIW0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sdccag3A2AIW0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms