Protein–RNA interactions for Protein: A2A825

Rsg1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsg1A2A825 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rsg1A2A825 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rsg1A2A825 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rsg1A2A825 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rsg1A2A825 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rsg1A2A825 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rsg1A2A825 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rsg1A2A825 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rsg1A2A825 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rsg1A2A825 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rsg1A2A825 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rsg1A2A825 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rsg1A2A825 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rsg1A2A825 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rsg1A2A825 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rsg1A2A825 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rsg1A2A825 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rsg1A2A825 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rsg1A2A825 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rsg1A2A825 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rsg1A2A825 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rsg1A2A825 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rsg1A2A825 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rsg1A2A825 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rsg1A2A825 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rsg1A2A825 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rsg1A2A825 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rsg1A2A825 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rsg1A2A825 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rsg1A2A825 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rsg1A2A825 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rsg1A2A825 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rsg1A2A825 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rsg1A2A825 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rsg1A2A825 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rsg1A2A825 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rsg1A2A825 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rsg1A2A825 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rsg1A2A825 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rsg1A2A825 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rsg1A2A825 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rsg1A2A825 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rsg1A2A825 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rsg1A2A825 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rsg1A2A825 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rsg1A2A825 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rsg1A2A825 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rsg1A2A825 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rsg1A2A825 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rsg1A2A825 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rsg1A2A825 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rsg1A2A825 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rsg1A2A825 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rsg1A2A825 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rsg1A2A825 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rsg1A2A825 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rsg1A2A825 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rsg1A2A825 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rsg1A2A825 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rsg1A2A825 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rsg1A2A825 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rsg1A2A825 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rsg1A2A825 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Rsg1A2A825 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rsg1A2A825 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rsg1A2A825 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rsg1A2A825 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsg1A2A825 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsg1A2A825 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsg1A2A825 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsg1A2A825 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsg1A2A825 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rsg1A2A825 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rsg1A2A825 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rsg1A2A825 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rsg1A2A825 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rsg1A2A825 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rsg1A2A825 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rsg1A2A825 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rsg1A2A825 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rsg1A2A825 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rsg1A2A825 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rsg1A2A825 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rsg1A2A825 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rsg1A2A825 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rsg1A2A825 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rsg1A2A825 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rsg1A2A825 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rsg1A2A825 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rsg1A2A825 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rsg1A2A825 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Rsg1A2A825 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rsg1A2A825 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rsg1A2A825 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rsg1A2A825 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rsg1A2A825 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rsg1A2A825 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rsg1A2A825 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rsg1A2A825 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rsg1A2A825 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms