Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDU1

Uncharacterized protein, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A286YDU1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A286YDU1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A286YDU1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A286YDU1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A286YDU1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A286YDU1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A286YDU1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A286YDU1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A286YDU1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A286YDU1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A286YDU1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A286YDU1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A286YDU1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A286YDU1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A286YDU1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A286YDU1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A286YDU1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A286YDU1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A286YDU1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A286YDU1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A286YDU1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A286YDU1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A286YDU1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A286YDU1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A286YDU1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A286YDU1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
A0A286YDU1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A286YDU1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A286YDU1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A286YDU1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A286YDU1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A286YDU1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A286YDU1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A286YDU1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A286YDU1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A286YDU1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A286YDU1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A286YDU1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A286YDU1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A286YDU1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A286YDU1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A286YDU1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A286YDU1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A286YDU1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A286YDU1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A286YDU1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A286YDU1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
A0A286YDU1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
A0A286YDU1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
A0A286YDU1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
A0A286YDU1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
A0A286YDU1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
A0A286YDU1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
A0A286YDU1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A286YDU1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A0A286YDU1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
A0A286YDU1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
A0A286YDU1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
A0A286YDU1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
A0A286YDU1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
A0A286YDU1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
A0A286YDU1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
A0A286YDU1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
A0A286YDU1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
A0A286YDU1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A0A286YDU1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
A0A286YDU1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
A0A286YDU1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
A0A286YDU1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A0A286YDU1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A0A286YDU1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A0A286YDU1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
A0A286YDU1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
A0A286YDU1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
A0A286YDU1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
A0A286YDU1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
A0A286YDU1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
A0A286YDU1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
A0A286YDU1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
A0A286YDU1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
A0A286YDU1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
A0A286YDU1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
A0A286YDU1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
A0A286YDU1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A0A286YDU1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A0A286YDU1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A286YDU1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A286YDU1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A286YDU1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A286YDU1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A286YDU1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A286YDU1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A286YDU1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A286YDU1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A286YDU1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A286YDU1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A286YDU1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A286YDU1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A286YDU1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A286YDU1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms