Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
A0A0U1RNP2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
A0A0U1RNP2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
A0A0U1RNP2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
A0A0U1RNP2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
A0A0U1RNP2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
A0A0U1RNP2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
A0A0U1RNP2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
A0A0U1RNP2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
A0A0U1RNP2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
A0A0U1RNP2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
A0A0U1RNP2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
A0A0U1RNP2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
A0A0U1RNP2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
A0A0U1RNP2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
A0A0U1RNP2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
A0A0U1RNP2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
A0A0U1RNP2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
A0A0U1RNP2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
A0A0U1RNP2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
A0A0U1RNP2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
A0A0U1RNP2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
A0A0U1RNP2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
A0A0U1RNP2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
A0A0U1RNP2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
A0A0U1RNP2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
A0A0U1RNP2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
A0A0U1RNP2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
A0A0U1RNP2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
A0A0U1RNP2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
A0A0U1RNP2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
A0A0U1RNP2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
A0A0U1RNP2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
A0A0U1RNP2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
A0A0U1RNP2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
A0A0U1RNP2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
A0A0U1RNP2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
A0A0U1RNP2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
A0A0U1RNP2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
A0A0U1RNP2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
A0A0U1RNP2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
A0A0U1RNP2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
A0A0U1RNP2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
A0A0U1RNP2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
A0A0U1RNP2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
A0A0U1RNP2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
A0A0U1RNP2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
A0A0U1RNP2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
A0A0U1RNP2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
A0A0U1RNP2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
A0A0U1RNP2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
A0A0U1RNP2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
A0A0U1RNP2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
A0A0U1RNP2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
A0A0U1RNP2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
A0A0U1RNP2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
A0A0U1RNP2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
A0A0U1RNP2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
A0A0U1RNP2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
A0A0U1RNP2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.55■■■□□ 2
A0A0U1RNP2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
A0A0U1RNP2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
A0A0U1RNP2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
A0A0U1RNP2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
A0A0U1RNP2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
A0A0U1RNP2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
A0A0U1RNP2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
A0A0U1RNP2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
A0A0U1RNP2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
A0A0U1RNP2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
A0A0U1RNP2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
A0A0U1RNP2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
A0A0U1RNP2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
A0A0U1RNP2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
A0A0U1RNP2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
A0A0U1RNP2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
A0A0U1RNP2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
A0A0U1RNP2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
A0A0U1RNP2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
A0A0U1RNP2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
A0A0U1RNP2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
A0A0U1RNP2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
A0A0U1RNP2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
A0A0U1RNP2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
A0A0U1RNP2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
A0A0U1RNP2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
A0A0U1RNP2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
A0A0U1RNP2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
A0A0U1RNP2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
A0A0U1RNP2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
A0A0U1RNP2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
A0A0U1RNP2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
A0A0U1RNP2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
A0A0U1RNP2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
A0A0U1RNP2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
A0A0U1RNP2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
A0A0U1RNP2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
A0A0U1RNP2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
A0A0U1RNP2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
A0A0U1RNP2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms