Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H5

Trbv20, T cell receptor beta, variable 20 (Fragment), mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv20A0A0B4J1H5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trbv20A0A0B4J1H5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trbv20A0A0B4J1H5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trbv20A0A0B4J1H5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trbv20A0A0B4J1H5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trbv20A0A0B4J1H5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trbv20A0A0B4J1H5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trbv20A0A0B4J1H5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trbv20A0A0B4J1H5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trbv20A0A0B4J1H5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trbv20A0A0B4J1H5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trbv20A0A0B4J1H5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trbv20A0A0B4J1H5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trbv20A0A0B4J1H5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trbv20A0A0B4J1H5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trbv20A0A0B4J1H5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trbv20A0A0B4J1H5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trbv20A0A0B4J1H5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trbv20A0A0B4J1H5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trbv20A0A0B4J1H5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trbv20A0A0B4J1H5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trbv20A0A0B4J1H5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trbv20A0A0B4J1H5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trbv20A0A0B4J1H5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trbv20A0A0B4J1H5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trbv20A0A0B4J1H5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trbv20A0A0B4J1H5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trbv20A0A0B4J1H5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trbv20A0A0B4J1H5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trbv20A0A0B4J1H5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trbv20A0A0B4J1H5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trbv20A0A0B4J1H5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trbv20A0A0B4J1H5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Trbv20A0A0B4J1H5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Trbv20A0A0B4J1H5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trbv20A0A0B4J1H5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trbv20A0A0B4J1H5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Trbv20A0A0B4J1H5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trbv20A0A0B4J1H5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trbv20A0A0B4J1H5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trbv20A0A0B4J1H5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trbv20A0A0B4J1H5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trbv20A0A0B4J1H5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trbv20A0A0B4J1H5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trbv20A0A0B4J1H5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trbv20A0A0B4J1H5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trbv20A0A0B4J1H5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trbv20A0A0B4J1H5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trbv20A0A0B4J1H5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trbv20A0A0B4J1H5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trbv20A0A0B4J1H5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trbv20A0A0B4J1H5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trbv20A0A0B4J1H5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trbv20A0A0B4J1H5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trbv20A0A0B4J1H5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trbv20A0A0B4J1H5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trbv20A0A0B4J1H5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trbv20A0A0B4J1H5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Trbv20A0A0B4J1H5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trbv20A0A0B4J1H5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trbv20A0A0B4J1H5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trbv20A0A0B4J1H5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trbv20A0A0B4J1H5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trbv20A0A0B4J1H5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trbv20A0A0B4J1H5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trbv20A0A0B4J1H5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trbv20A0A0B4J1H5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trbv20A0A0B4J1H5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trbv20A0A0B4J1H5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Trbv20A0A0B4J1H5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trbv20A0A0B4J1H5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trbv20A0A0B4J1H5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trbv20A0A0B4J1H5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trbv20A0A0B4J1H5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trbv20A0A0B4J1H5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Trbv20A0A0B4J1H5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trbv20A0A0B4J1H5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trbv20A0A0B4J1H5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trbv20A0A0B4J1H5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trbv20A0A0B4J1H5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trbv20A0A0B4J1H5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trbv20A0A0B4J1H5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trbv20A0A0B4J1H5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trbv20A0A0B4J1H5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Trbv20A0A0B4J1H5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trbv20A0A0B4J1H5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trbv20A0A0B4J1H5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Trbv20A0A0B4J1H5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trbv20A0A0B4J1H5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trbv20A0A0B4J1H5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trbv20A0A0B4J1H5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trbv20A0A0B4J1H5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trbv20A0A0B4J1H5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trbv20A0A0B4J1H5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trbv20A0A0B4J1H5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trbv20A0A0B4J1H5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trbv20A0A0B4J1H5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trbv20A0A0B4J1H5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Trbv20A0A0B4J1H5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trbv20A0A0B4J1H5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms