Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms