Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC26

Slc46a3, Solute carrier family 46 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a3Q9DC26 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc46a3Q9DC26 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 371.8 ms