Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms