Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK1

Znhit3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znhit3Q9CQK1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Znhit3Q9CQK1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znhit3Q9CQK1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znhit3Q9CQK1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znhit3Q9CQK1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znhit3Q9CQK1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znhit3Q9CQK1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Znhit3Q9CQK1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Znhit3Q9CQK1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Znhit3Q9CQK1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Znhit3Q9CQK1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Znhit3Q9CQK1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znhit3Q9CQK1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znhit3Q9CQK1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znhit3Q9CQK1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znhit3Q9CQK1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znhit3Q9CQK1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znhit3Q9CQK1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Znhit3Q9CQK1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Znhit3Q9CQK1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Znhit3Q9CQK1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Znhit3Q9CQK1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Znhit3Q9CQK1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Znhit3Q9CQK1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Znhit3Q9CQK1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Znhit3Q9CQK1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Znhit3Q9CQK1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Znhit3Q9CQK1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znhit3Q9CQK1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znhit3Q9CQK1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znhit3Q9CQK1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znhit3Q9CQK1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znhit3Q9CQK1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znhit3Q9CQK1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Znhit3Q9CQK1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znhit3Q9CQK1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znhit3Q9CQK1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znhit3Q9CQK1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znhit3Q9CQK1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Znhit3Q9CQK1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znhit3Q9CQK1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znhit3Q9CQK1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Znhit3Q9CQK1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znhit3Q9CQK1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znhit3Q9CQK1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znhit3Q9CQK1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Znhit3Q9CQK1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Znhit3Q9CQK1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Znhit3Q9CQK1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Znhit3Q9CQK1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znhit3Q9CQK1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Znhit3Q9CQK1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znhit3Q9CQK1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Znhit3Q9CQK1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znhit3Q9CQK1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znhit3Q9CQK1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znhit3Q9CQK1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znhit3Q9CQK1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Znhit3Q9CQK1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znhit3Q9CQK1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Znhit3Q9CQK1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znhit3Q9CQK1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znhit3Q9CQK1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znhit3Q9CQK1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znhit3Q9CQK1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znhit3Q9CQK1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Znhit3Q9CQK1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Znhit3Q9CQK1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Znhit3Q9CQK1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Znhit3Q9CQK1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Znhit3Q9CQK1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Znhit3Q9CQK1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Znhit3Q9CQK1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Znhit3Q9CQK1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Znhit3Q9CQK1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Znhit3Q9CQK1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Znhit3Q9CQK1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Znhit3Q9CQK1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Znhit3Q9CQK1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Znhit3Q9CQK1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Znhit3Q9CQK1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Znhit3Q9CQK1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Znhit3Q9CQK1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Znhit3Q9CQK1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Znhit3Q9CQK1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znhit3Q9CQK1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znhit3Q9CQK1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Znhit3Q9CQK1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znhit3Q9CQK1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znhit3Q9CQK1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znhit3Q9CQK1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znhit3Q9CQK1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znhit3Q9CQK1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znhit3Q9CQK1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Znhit3Q9CQK1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znhit3Q9CQK1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Znhit3Q9CQK1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Znhit3Q9CQK1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znhit3Q9CQK1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znhit3Q9CQK1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms